Скачать 199.33 Kb.
|
Раздел 3.Краткий иллюстрированный (с картинками в тексте) отчет о работе за отчетный период, объемом 2 -3 стр. со ссылками на вышедшие и посланные в печать работы. Изучение влияния холестерина на динамику молекул в модельных мембранах Метод стимулированного эха для спиновых меток в исследуемых фосфолипидных модельных мембранах позволил обнаружить и разделить вклады от быстрых наносекундных либраций и медленных микросекундных вращательных движений в диапазоне углов 0,1о-1о. Установлено, что присутствие холестерина в мембране подавляет медленные вращательные движения, что свидетельствует о повышении ориентационной устойчивости липидов в мембране и может быть связано с конденсирующим эффектом холестерина. Присутствие холестерина в мембране увеличивает амплитуды быстрых либраций, этот эффект может быть связан с упорядочивающим действием холестерина. Также найдено, что добавление холестерина в мембрану приводит к сегрегации меченых и немеченых липидов, что может быть связано с образованием рафтов. На рисунке показана скорости релаксации для образцов без холестерина (слева) и с холестерином (справа). (N. P. Isaev, V. N. Beloslyudtseva, and S. A. Dzuba, Influence of cholesterol on molecular motions in spin-labeled lipid bilayers observed by stimulated ESE, Appl. Magn. Reson., в печати). Рисунок 1. Скорости релаксации для образца без холестерина (слева) и с холестерином (справа) Агрегация пептида-антибиотика аламетицина в мембранах еРС Спектроскопия PELDOR была использована для изучения самоагрегации пептида-антибиотика аламетицина в везикулярных мембранах при соотношениях пептид : липид от 1 : 70 до 1 : 200. Пептид содержал спиновые метки ТОАС (одна метка на молекулу), в положениях 1, 8 или 16 аминокислотной последовательности. Из данных PELDOR получены межмолекулярные функции распределения и данные о числе молекул пептида в агрегатах. Это число оказалось близким к 4. Функция распределения показывает максимум вблизи 2,3 нм. Для пептидов с метками в положениях 1 и 8 дополнительно обнаружены максимумы вблизи 3,2 и 5,2 нм. Из данных по модуляции эха определена качественно глубина погружения метки внутрь мембраны. Найдено, что эта глубина уменьшается в ряду ТОАС-1, ТОАС-8, ТОАС-16. Полученные данные позволили построить геометрическую модель надмолекулярной структуры агрегатов. (Milov A.D., Samoilova R.I., Tsvetkov Yu.D., DeZotti M., Formaggio F., Toniolo C., Handgraaf J.-W., Raap J. Structure of self-aggregated alamethicin in ePC membranes detected by pulsed electron-electron double resonance and electron spin echo envelope modulation spectroscopies // Biophys. J., 96, 3197-3209 (2009)). Применение метода двойного резонанса PELDOR к изучению конформаций ДНК В литературе предполагается, что специфические структурные конформации ДНК с поврежденными основаниями являются факторами, которые способствуют репарирующим ферментам находить эти основания. Поэтому необходимо развитие соответствующих экспериментальных подходов для изучения этих конформаций. Нами был применен импульсный электрон-электронный двойной резонанс (PELDOR) для изучения конформаций дважды-спин-меченой одноцепочечной ДНК и двухцепочечной ДНК длиной в 12 оснований, содержащей в одной из цепочек поврежденное или неповрежденное гуаниновое основание –см. рис. 2. Также были исследованы конформации ДНК, в которые были введены ненуклеотидные вставки, формирующие «петлю» в одной из цепочек. Установлено, что распределение по расстояниям между метками в случае двухцепочечного дуплекса намного уже, чем в одноцепочечном случае. Найдено, что введение поврежденного основания приводит к изгибу дуплекса в месте введения примерно на 20о – см. схематическое изображение на рис. 3. Введение ненуклетидной вставки помимо изгиба приводит также к заметному уширению распределения. (Kuznetsov N.A., Milov A.D., Koval V.V., Samoilova R.I., Grishin Y.A., Knorre D.G., Tsvetkov Y.D., Fedorova O.S., Dzuba S.A. PELDOR study of conformations of double-spin-labeled single- and double-stranded DNA with non-nucleotide inserts// Phys. Chem. Chem. Phys., 11, 6826-6832 (2009)). Рис. 2. Структура изученного дуплекса ДНК 4 нмРис. 3. Схематическое представления изгиба ДНК при введении ненуклеотидной вставки.Раздел 4.Основной результат лаборатории в текущем году. Формулировка результата с указанием его значимости в 6-8 строк плюс пояснение в полстраницы без ссылок и плюс цветная картинка на отдельном листе с подписью. С целью поиска возможного молекулярного механизма поиска репарирующими ферментами поврежденного основания в ДНК применен импульсный электрон-электронный двойной резонанс (PELDOR) дважды-спин-меченых ДНК. Метод позволяет измерять расстояния между спиновыми метками порядка нескольких нм. Найдено, что введение поврежденного основания приводит к изгибу дуплекса в месте введения примерно на 20о – см. схематическое изображение на рисунке. Введение ненуклеотидной вставки помимо изгиба приводит также к заметному уширению распределения. Обнаруженные изменения конформаций могут дать ключ к пониманию механизма поиска поврежденного основания репарирующими ферментами. (Совместно и ИХБФМ СО РАН). Пояснение В работе методом PELDOR изучались конформации дважды-спин-меченой одноцепочечной ДНК и двухцепочечной ДНК длиной 12 оснований, содержащей в одной из цепочек поврежденное или неповрежденное гуаниновое основание. Также были исследованы конформации ДНК, в которые были введены ненуклеотидные вставки, формирующие «петлю» в одной из цепочек. Установлено, что распределение по расстояниям между метками в случае двухцепочечного дуплекса намного уже, чем в одноцепочечном случае. Найдено, что введение поврежденного основания приводит к изгибу дуплекса в месте введения примерно на 20о – см. схематическое изображение на рисунке. Введение ненуклетидной вставки помимо изгиба приводит также к заметному уширению распределения. Результаты показывают эффективность применения метода к изучению изменения конформаций ДНК при наличии повреждений в их структуре. 4 нмПодпись к рисунку: Схематическое представление обнаруженного методом PELDOR изгиба дважды-спин-меченой 12-членной ДНК в результате введения ненуклеотидной вставки |
3. основные характеристики наблюдаемых случайностей И детерминированность наблюдений. Случайность "истинная" и моделируемая, детерминированный хаос. Компьютерные системы пользователя... | Анализ денежно-кредитной политики ЦБ россии с учетом природы внутренних и внешних шоков | ||
Как применять External Script-ы к объектам Именно на этих внешних скриптах и построена вся наша оригинальная gta – San Andreas | Что мы понимаем под образованностью человека? А развивается под влиянием внутренних и внешних, объективных и субъективных факторов | ||
Правило (стандарт) n 18. Получение аудитором подтверждающей информации из внешних источников Утверждено на заседании кафедры экономического анализа и аудита кгфэи (протокол №4 от 26 декабря 2007 г.) | Урок географии в 6 классе с использованием учебника «География» Цели урока: Сформировать знания о рельефе Земли и его создании под взаимодействием внутренних и внешних сил | ||
1. Цели и задачи дисциплины Цель курса Международной торговой палаты, а также подготовка специалистов к работе по организации и обеспечению лизинговых операций на внутреннем... | Тема. Организм человека Цель: уточнить и расширить представления обучающихся об организме человека: его внешних частях тела, органах чувств | ||
Язык шотландии scots как продукт внешних и внутренних взаимодействий Работа выполнена на кафедре английской филологии факультета иностранных языков Ленинградского государственного университета им. А.... | Приказ допустить к государственным экзаменам Министерства внутренних... Совета по сохранению исторически ценных градоформирующих объектов исторических поселений Вологодской области | ||
Реферат " Базовая система ввода-вывода bios" Это часть программного обеспечения pc, поддерживающая управление адаптерами внешних устройств, экранные операции, тестирование, начальную... | Решение круга проблем отрицательных внешних эффектов в России ... | ||
Программа по формированию навыков безопасного поведения на дорогах... ... | Рельеф суши Урок Познакомить учащихся с процессами, которые формируют рельеф. Обосновать причины разнообразия рельефа как результат взаимодействия... | ||
Реферат Часы величайшее техническое изобретение человечества Однако из-за своей зависимости от внешних условий и их колебаний, равно как и из-за технического несовершенства эти средства измерения... | Доклад Комиссии рспп по рыбному хозяйству и аквакультуре Стратегическая логика разработки основных мер развития российского рынка рыбопродукции и повышения продаж продукции с высокой степенью... |