Внешних





Скачать 199.33 Kb.
НазваниеВнешних
страница3/3
Дата публикации11.03.2015
Размер199.33 Kb.
ТипПрограмма
100-bal.ru > Химия > Программа
1   2   3

Раздел 3.


Краткий иллюстрированный (с картинками в тексте) отчет о работе за отчетный период, объемом 2 -3 стр. со ссылками на вышедшие и посланные в печать работы.

Изучение влияния холестерина на динамику молекул в модельных мембранах

Метод стимулированного эха для спиновых меток в исследуемых фосфолипидных модельных мембранах позволил обнаружить и разделить вклады от быстрых наносекундных либраций и медленных микросекундных вращательных движений в диапазоне углов 0,1о-1о. Установлено, что присутствие холестерина в мембране подавляет медленные вращательные движения, что свидетельствует о повышении ориентационной устойчивости липидов в мембране и может быть связано с конденсирующим эффектом холестерина. Присутствие холестерина в мембране увеличивает амплитуды быстрых либраций, этот эффект может быть связан с упорядочивающим действием холестерина. Также найдено, что добавление холестерина в мембрану приводит к сегрегации меченых и немеченых липидов, что может быть связано с образованием рафтов. На рисунке показана скорости релаксации для образцов без холестерина (слева) и с холестерином (справа). (N. P. Isaev, V. N. Beloslyudtseva, and S. A. Dzuba, Influence of cholesterol on molecular motions in spin-labeled lipid bilayers observed by stimulated ESE, Appl. Magn. Reson., в печати).





Рисунок 1. Скорости релаксации для образца без холестерина (слева) и с холестерином (справа)

Агрегация пептида-антибиотика аламетицина в мембранах еРС
Спектроскопия PELDOR была использована для изучения самоагрегации пептида-антибиотика аламетицина в везикулярных мембранах при соотношениях пептид : липид от 1 : 70 до 1 : 200. Пептид содержал спиновые метки ТОАС (одна метка на молекулу), в положениях 1, 8 или 16 аминокислотной последовательности. Из данных PELDOR получены межмолекулярные функции распределения и данные о числе молекул пептида в агрегатах. Это число оказалось близким к 4. Функция распределения показывает максимум вблизи 2,3 нм. Для пептидов с метками в положениях 1 и 8 дополнительно обнаружены максимумы вблизи 3,2 и 5,2 нм. Из данных по модуляции эха определена качественно глубина погружения метки внутрь мембраны. Найдено, что эта глубина уменьшается в ряду ТОАС-1, ТОАС-8, ТОАС-16. Полученные данные позволили построить геометрическую модель надмолекулярной структуры агрегатов. (Milov A.D., Samoilova R.I., Tsvetkov Yu.D., DeZotti M., Formaggio F., Toniolo C., Handgraaf J.-W., Raap J. Structure of self-aggregated alamethicin in ePC membranes detected by pulsed electron-electron double resonance and electron spin echo envelope modulation spectroscopies // Biophys. J., 96, 3197-3209 (2009)).
Применение метода двойного резонанса PELDOR к изучению конформаций ДНК
В литературе предполагается, что специфические структурные конформации ДНК с поврежденными основаниями являются факторами, которые способствуют репарирующим ферментам находить эти основания. Поэтому необходимо развитие соответствующих экспериментальных подходов для изучения этих конформаций. Нами был применен импульсный электрон-электронный двойной резонанс (PELDOR) для изучения конформаций дважды-спин-меченой одноцепочечной ДНК и двухцепочечной ДНК длиной в 12 оснований, содержащей в одной из цепочек поврежденное или неповрежденное гуаниновое основание –см. рис. 2. Также были исследованы конформации ДНК, в которые были введены ненуклеотидные вставки, формирующие «петлю» в одной из цепочек. Установлено, что распределение по расстояниям между метками в случае двухцепочечного дуплекса намного уже, чем в одноцепочечном случае. Найдено, что введение поврежденного основания приводит к изгибу дуплекса в месте введения примерно на 20о – см. схематическое изображение на рис. 3. Введение ненуклетидной вставки помимо изгиба приводит также к заметному уширению распределения. (Kuznetsov N.A., Milov A.D., Koval V.V., Samoilova R.I., Grishin Y.A., Knorre D.G., Tsvetkov Y.D., Fedorova O.S., Dzuba S.A. PELDOR study of conformations of double-spin-labeled single- and double-stranded DNA with non-nucleotide inserts// Phys. Chem. Chem. Phys., 11, 6826-6832 (2009)).


Рис. 2. Структура изученного дуплекса ДНК

4 нм

Рис. 3. Схематическое представления изгиба ДНК при введении ненуклеотидной вставки.

Раздел 4.


Основной результат лаборатории в текущем году. Формулировка результата с указанием его значимости в 6-8 строк плюс пояснение в полстраницы без ссылок и плюс цветная картинка на отдельном листе с подписью.
С целью поиска возможного молекулярного механизма поиска репарирующими ферментами поврежденного основания в ДНК применен импульсный электрон-электронный двойной резонанс (PELDOR) дважды-спин-меченых ДНК. Метод позволяет измерять расстояния между спиновыми метками порядка нескольких нм. Найдено, что введение поврежденного основания приводит к изгибу дуплекса в месте введения примерно на 20о – см. схематическое изображение на рисунке. Введение ненуклеотидной вставки помимо изгиба приводит также к заметному уширению распределения. Обнаруженные изменения конформаций могут дать ключ к пониманию механизма поиска поврежденного основания репарирующими ферментами. (Совместно и ИХБФМ СО РАН).
Пояснение

В работе методом PELDOR изучались конформации дважды-спин-меченой одноцепочечной ДНК и двухцепочечной ДНК длиной 12 оснований, содержащей в одной из цепочек поврежденное или неповрежденное гуаниновое основание. Также были исследованы конформации ДНК, в которые были введены ненуклеотидные вставки, формирующие «петлю» в одной из цепочек. Установлено, что распределение по расстояниям между метками в случае двухцепочечного дуплекса намного уже, чем в одноцепочечном случае. Найдено, что введение поврежденного основания приводит к изгибу дуплекса в месте введения примерно на 20о – см. схематическое изображение на рисунке. Введение ненуклетидной вставки помимо изгиба приводит также к заметному уширению распределения. Результаты показывают эффективность применения метода к изучению изменения конформаций ДНК при наличии повреждений в их структуре.

4 нм


Подпись к рисунку: Схематическое представление обнаруженного методом PELDOR изгиба дважды-спин-меченой 12-членной ДНК в результате введения ненуклеотидной вставки
1   2   3

Похожие:

Внешних icon3. основные характеристики наблюдаемых случайностей
И детерминированность наблюдений. Случайность "истинная" и моделируемая, детерминированный хаос. Компьютерные системы пользователя...
Внешних iconАнализ денежно-кредитной политики ЦБ россии с учетом природы внутренних и внешних шоков

Внешних iconКак применять External Script-ы к объектам
Именно на этих внешних скриптах и построена вся наша оригинальная gta – San Andreas
Внешних iconЧто мы понимаем под образованностью человека?
А развивается под влиянием внутренних и внешних, объективных и субъективных факторов
Внешних iconПравило (стандарт) n 18. Получение аудитором подтверждающей информации из внешних источников
Утверждено на заседании кафедры экономического анализа и аудита кгфэи (протокол №4 от 26 декабря 2007 г.)
Внешних iconУрок географии в 6 классе с использованием учебника «География»
Цели урока: Сформировать знания о рельефе Земли и его создании под взаимодействием внутренних и внешних сил
Внешних icon1. Цели и задачи дисциплины Цель курса
Международной торговой палаты, а также подготовка специалистов к работе по организации и обеспечению лизинговых операций на внутреннем...
Внешних iconТема. Организм человека
Цель: уточнить и расширить представления обучающихся об организме человека: его внешних частях тела, органах чувств
Внешних iconЯзык шотландии scots как продукт внешних и внутренних взаимодействий
Работа выполнена на кафедре английской филологии факультета иностранных языков Ленинградского государственного университета им. А....
Внешних iconПриказ допустить к государственным экзаменам Министерства внутренних...
Совета по сохранению исторически ценных градоформирующих объектов исторических поселений Вологодской области
Внешних iconРеферат " Базовая система ввода-вывода bios"
Это часть программного обеспечения pc, поддерживающая управление адаптерами внешних устройств, экранные операции, тестирование, начальную...
Внешних iconРешение круга проблем отрицательных внешних эффектов в России
...
Внешних iconПрограмма по формированию навыков безопасного поведения на дорогах...
...
Внешних iconРельеф суши Урок
Познакомить учащихся с процессами, которые формируют рельеф. Обосновать причины разнообразия рельефа как результат взаимодействия...
Внешних iconРеферат Часы величайшее техническое изобретение человечества
Однако из-за своей зависимости от внешних условий и их колебаний, равно как и из-за технического несовершенства эти средства измерения...
Внешних iconДоклад Комиссии рспп по рыбному хозяйству и аквакультуре
Стратегическая логика разработки основных мер развития российского рынка рыбопродукции и повышения продаж продукции с высокой степенью...


Школьные материалы


При копировании материала укажите ссылку © 2013
контакты
100-bal.ru
Поиск