Спектральные методы исследования в биохимии





НазваниеСпектральные методы исследования в биохимии
страница4/5
Дата публикации15.12.2014
Размер0.56 Mb.
ТипСамостоятельная работа
100-bal.ru > Химия > Самостоятельная работа
1   2   3   4   5
ТЕМА 8.

Инфракрасная спектрофотометрия.

Указания к изучению темы.

Инфракрасная область электромагнитного излучения делится на ближнюю инфракрасную (1 – 2 мкм), инфракрасную (2 – 25 мкм) и дальнюю инфракрасную области (25 – 250). Наиболее часто применяется область 2,5  - 250 мкм.

Для ассимметричной молекулы, состоящей из n атомов, возможны 3n - 6 нормальных колебаний, из которых 2n – 5 приводит к деформации связей и n – 1 к их растяжению. Колебания, сопровождающиеся изменением дипольного момента, т.е. смещения заряда, наблюдаются в инфракрасной области. Другие колебания регистрируются с помощью спектроскопии комбинционного рассеяния (рамановской спектроскопии). Инфракрасные спектры абсолютно специфичны, поэтому их можно считать своеобразными «отпечатками пальцев» молекул. Инфракрасные спектры для таких молекул, как вода или двуокись углерода, довольно легко идентифицировать. Но биохимикам больше интересны молекулы очень большого размера; молекула же, содержащая 50 атомов, имеет уже 144 нормальных колебания.

К счастью, благодаря ряду обстоятельств, ситуация может существенно упрощаться. Некоторые полосы в инфракрасных спектрах разных молекул появляются при одних и тех же длинах волн и относятся к одинаковым группам атомов в молекулах. Это аналогично спектрам поглощения хромофоров. Такие «группы частот» – важный компонент при исследовании спектров ( инфракрасные спектры – колебательные спектры, поэтому их принято строить в частотах, а не длинах волн). Очень полезен для анализа тот факт, что поглощение группы атомов в молекуле зависит от её окружения – частоты колебаний сдвигаются в ту или иную сторону. Так удается различить колебания С – Н-связи в группах =СН2 и – СН3. При увеличении энергии связи атомов, например при образовании двойных связей, частота колебаний растяжения связей увеличивается, то есть уменьшается длина волны поглощенного света. При увеличении приведенной массы связанных атомов частота колебаний атомов уменьшается, то есть поглощается свет большей длины волны. Для любой связи частота деформационных колебаний меньше частоты колебаний растяжения связей.

Все промышленные инфракрасные спектрофотометры, использующиеся для аналитических целей, двухлучевые. В таких приборах все побочные эффекты, обусловленные растворителем и примесями, автоматически компенсируются, также снимаются сложности, связанные с сильным поглощением двуокиси углерода и паров воды. В качестве монохроматоров чаще используют дифракционные решетки из-за их большей экономичности. Образцы нельзя приготавливать в воде, поскольку она, как и органические растворители, очень сильно поглощает в инфракрасной области. Вода также растворяет почти все вещества, прозрачные в инфракрасной области. Образец следует экранировать от источника света, чтобы его температура не увеличивалась больше, чем на 50С в 1 час.

Несмотря на старания использовать инфракрасную спектрофотометрию для изучения биологических макромолекул и мембран, основное применение этого метода в биохимии – исследование структур биологических молекул среднего размера. Он обычно используется в сочетании с ядерным магнитным резонансом и масс-спектрометрией.

Когда видимый монохроматический свет проходит через прозрачную среду, часть его выходит не поглотившись, часть поглощается, а 10- 6 падающего света рассеивается под прямым углом к падающему свету. Чуть менее 1% рассеянного света имеет другую длину волны – явление, названное эффектом Рамана (эффектом комбинационного рассеяния света). Эффект Рамана обусловлен тем, что возбужденные светом молекулы, потеряв избыточную энергию, не всегда возвращаются на исходный колебательный подуровень, поэтому свет, испускаемый ими, может иметь как меньшую, так и большую длину волны. Волновые числа, определяющие отличие линий комбинационного рассеяния света от линий возбуждающего света, соответствуют расположению колебательных энергетических подуровней в молекуле и располагаются в инфракрасной области. Регистрируемые колебания отвечают изменению поляризуемости молекулы, а не дипольного момента. Поэтому спектры комбинационного рассеяния света дополняют информацию, полученную посредством инфракрасной спектроскопии, и также используются для изучения структуры молекул.

Поскольку рамановское излучение очень слабое, соответствующие приборы появились лишь после развития лазерной техники. Рамановские спектрофотометры регистрируют колебания в видимой и ближней инфракрасной области даже для водных растворов биологических соединений, которые очень сильно поглощают в инфракрасной области. Однако эта методика используется в биохимии редко. Спектроскопия комбинационного рассеяния света, также используется для исследования структур органических молекул среднего размера.

Литература к теме 8:

  1. Ельяшевич М.А. Атомная и молекулярная спектроскопия. Общие вопросы спектроскопии. М.: Либроком, 2010.

  2. Ельяшевич М.А. Атомная и молекулярная спектроскопия. Молекулярная спектроскопия. М.: Либроком, 2008.

  3. Беккер Ю. Спектроскопия. М.: Техносфера, 2009.

  4. Кудряшов Ю. Б., Перов Ю. Ф. Рубин А. Б. Радиационная биофизика: радиочастотные и микроволновые электромагнитные излучения. Учебник для ВУЗов. — М.: ФИЗМАТЛИТ, 2008.

  5. Подавалова О.П., Лямкина Н.Э. Спектроскопия атомов и молекул. Красноярск: СФУ, 2007. Электронный ресурс.

  6. Владимиров Ю.А., Проскурнина Е.В. Лекции по медицинской биофизике. М.:Издательство МГУ. 2007.

  7. Joseph R. Lakowicz. Principles of Fluorescence Spectroscopy / R. J. Lakowicz. -N.Y.: Springer Science, 2006. — 960 p.

  8. Ландау Л. Д., Лифшиц Е. М. Квантовая механика (нерелятивистская теория). — Издание 6-е, исправленное. — М.: Физматлит, 2004.

  9. Остерман Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. М.: МЦНМО, 2002.

  10. Bernard Valeur Molecular Fluorescence: Principles and Applications. — Wiley-VCH Verlag GmbH, 2001.

  11. Коэн-Таннуджи К., Диу Б., Лалоэ Ф. Квантовая механика. Т.1. Екатеринбург: Изд-во Уральского ун-та, 2000.

  12. Коэн-Таннуджи К., Диу Б., Лалоэ Ф. Квантовая механика. Т.2. Екатеринбург: Изд-во Уральского ун-та, 2000.

  13. Banwell C.N., McCash Fundamentals of molecular spectoroscopy. McGraw-Hill Book (Europe), York 1995.

  14. Уильям Б., Уилсон К. Методы практической биохимии. М.: Мир, 1978.



Вопросы для самоконтроля.


  1. В чем состоят особенности инфракрасных спектров биологических молекул?

  2. Колебания какого вида ответственны за инфракрасные спектры молекул?

  3. Назовите правила отбора для вращательных и колебательных переходов в молекулах.

  4. Что можно сказать про инфракрасные спектры одинаковых групп атомов в разных биологических соединениях?

  5. Какую информацию о свойствах молекул, можно получить при исследовании их инфракрасных спектров?

  6. В чем состоит специфика измерения инфракрасных спектров биологических молекул?

  7. Перечислите методы измерения инфракрасных спектров биологических молекул.

  8. В чем состоит эффект Рамана?

  9. Назовите основные закономерности комбинационного рассеяния света.

  10. Перечислите методы измерения спектров комбинационного рассеяния света биологических молекул.

  11. Охарактеризуйте значение методов комбинационного рассеяния света для исследования биологически важных соединений.

Указания по написанию реферата.

Одной из форм самостоятельной работы студентов является написание

реферата. Реферат – краткое описание рецензируемых текстов с набором

ключевых понятий и основных положений. Работа над рефератом способствует повышению общей и профессиональной эрудиции студентов. Реферирование может быть посвящено отдельной проблеме или содержать обобщение разных точек зрения по определенной теме. Автор реферата определяет свое отношение к рассматриваемым научным позициям, взглядам или определениям, принадлежащим различным авторам. Реферат должен представлять собой научную ценность, поэтому подход студента к написанию реферата должен иметь исследовательский характер. При подготовке реферата следует использовать монографии, обзоры и оригинальные научные статьи.

Выполнение реферативных работ осуществляется в несколько этапов: выбор темы, составление плана, проработка литературных источников с их

анализом, написание и защита реферата. Тема реферата выбирается из рекомендованного списка или по предложению студента (с согласия преподавателя).

Рекомендуемый объём реферата – около 20 страниц компьютерного набора через 1,5 интервала. Высота букв (кегль) – 14. Текст должен быть напечатан на одной стороне стандартного листа белой бумаги формата А4

(210 х 297 мм). Страницы должны иметь поля: левое – 30 мм; верхнее – 25 мм; правое – 15 мм; нижнее – 20 мм. Страницы нумеруются вверху (от центра). К реферату прилагается презентационный материал, включающий

около 10 слайдов. Структура реферата и правила оформления рисунков, схем, цитируемой литературы аналогичны требуемым для курсовых и дипломных работ.

Примерные темы рефератов

для самостоятельной работы студентов

  1. Место спектральных методов в биохимических исследованиях.

  2. Преимущества спектральных методов исследований в биохимии.

  3. Спектрофотометрический метод анализа. Законы поглощения электромагнитного излучения.

  4. Основные спектральные методы исследования в биохимии.

  5. Принципы фотометрических методов, применяемых в биохимии.

  6. Биохимические исследования, которые можно проводить, используя фотометрические методы.

  7. Теория, используемая для понимания механизмов, лежащих в основе спектральных свойств атомов и молекул.

  8. Процессы в атомах и молекулах, происходящие при поглощении и излучении квантов.

  9. Виды спектров, изучаемых в биохимии.

  10. Выполнимость закона Ламберта-Бэра для растворов.

  11. Количественное определение вещества в растворах спектальными методами.

  12. Определение концентрации вещества в исследуемых растворах в случае отклонений от закона Ламберта-Бэра.

  13. Закономерности молекулярной фотолюминесценции. Практическое применение метода.

  14. Задачи исследователя при проведении количественного спектрофотометрического анализа.

  15. Спектры поглощения вещества.

  16. Применение спектрофотометрии при идентификации органических соединений в составе биологических препаратов.

  17. Достоверность и воспроизводимость результататов калориметрических измерений.

  18. Количественное определение ферментов, когда в результате реакций, катализируемых ими, образуется окрашенный продукт.

  19. Примеры использования методов разностной (дифференциальной) спектрофотометрии.

  20. Отличие разностной спектрофотометрии от прямых спектрофотометрических методов.

  21. Особенности инфракрасных спектров биологических молекул.

  22. Значение методов комбинационного рассеяния света для исследования биологически важных соединений.


Основной список литературы

  1. Ельяшевич М.А. Атомная и молекулярная спектроскопия. Ч.1 Общие вопросы спектроскопии. М.: Либроком, 2010 (15 экземпляров в библ. СФУ).

  2. Ельяшевич М.А. Атомная и молекулярная спектроскопия. Ч.2. . Атомная спектроскопия. М.: Либроком, 2008 (15 экземпляров в библ. СФУ).

  3. Ельяшевич М.А. Атомная и молекулярная спектроскопия. Ч.3. Молекулярная спектроскопия. М.: Либроком, 2008 (25 экземпляров в библ. СФУ).

  4. Подавалова О.П., Лямкина Н.Э. Спектроскопия атомов и молекул: Метод. указ. к решению задач / Н.Э. Лямкина, О.П. Подавалова, М.А. Таранова, И.В. Тимофеев ; Краснояр. гос. техн. ун-т. - Красноярск : ИПЦ КГТУ, 2004 (71 экземпляр в библ. СФУ).

  5. Березов Т.Т., Коровкин Б.Ф. Биологическая химия. 3-е изд., Москва : Медицина, 2007 (30 экземпляров в библ. СФУ).

  6. Северин Е.С., Николаев А.Я. Биохимия : краткий курс с упражнениями и задачами. 3-е изд., Москва : ГЭОТАР-МЕД, 2005 (15 экземпляров в библ. СФУ).

  7. Кругляков П.М., Хаскова Т.Н. Физическая и коллоидная химия. Учебное пособие. Изд. 2-е, испр. М.: Высшая школа, 2007 (60 экземпляров в библ. СФУ).

Список дополнительной литературы

  1. Беккер Ю. Спектроскопия. М.: Техносфера, 2009 (3 экземпляра в библ. СФУ).

  2. Грибов Л.А. Элементы квантовой теории, строения и свойств молекул. М.: Интеллект, 2010 (5 экземпляров в библ. СФУ).

  3. Николаев, А. Я. Биологическая химия : учеб. / А. Я. Николаев. – 3-е изд., перераб. и доп. - Москва: Медицинское информационное агентство, 2004 (3 экземпляра в библ. СФУ).

  4. Владимиров Ю.А., Потапенко А.Я. Физико-химические основы фотобиологических процессов: учебник. М. Дрофа. 2006 (1 экземпляр в библ. СФУ).

  5. Вавилова Т.П., Евстафьева О.Л., Островская И.Г. Практикум по биохимии. М.: Веди. 2009.

  6. Владимиров Ю.А., Проскурнина Е.В. Лекции по медицинской биофизике. М.:Издательство МГУ. 2007.

  7. Остерман Л.А. Методы исследования белков и нуклеиновых кислот. М.: МЦНМО, 2002.

  8. Коэн-Таннуджи К., Диу Б., Лалоэ Ф. Квантовая механика. Т.1. Екатеринбург: Изд-во Уральского ун-та, 2000.

  9. Коэн-Таннуджи К., Диу Б., Лалоэ Ф. Квантовая механика. Т.2. Екатеринбург: Изд-во Уральского ун-та, 2000.

  10. McHale J.L. Molecular Spectroscopy. Prentice Hall. N 9, 1999.

  11. Kohen E., Santus R., Hirschberg J. G. Photobiology. New York. San Diego. Academic Press. 1998.

  12. Michael Hollas J. Modern Spectroscopy. Second Edition. John Wily and Sons. 1995.

  13. Филиппович Ю.Б. Основы биохимии. – 4-е издание, перераб. и доп. - М: изд-во "Агар", 1999.

  14. Владимиров Ю.А. Соросовский образовательный журнал. Издат. ISSN. N 6. 1999.

  15. Рубин А.Б. Соросовский образовательный журнал. Издат. ISSN. N 4. 2000.

  16. Banwell C.N., McCash Fundamentals of molecular spectoroscopy. McGraw-Hill Book (Europe), York 1995.

  17. Уильям Б., Уилсон К. Методы практической биохимии. М.: Мир, 1978.

Перечень примерных контрольных вопросов к зачету по курсу «Спектральные методы исследования в биохимии»

  1. Спектр электромагнитного излучения, его основные характеристики и способы их выражения (длина волны, частота, волновое число, поток излучения, интенсивность). Ультрафиолетовая, видимая и инфракрасная области спектра.

  2. Классификация спектроскопических методов.

  3. Спектрофотометрический метод анализа. Сущность метода. Законы поглощения электромагнитного излучения и способы их выражения.

  4. Закон Бугера-Ламберта-Бера, его математическое выражение. Величины, характеризующие поглощение. Молярный коэффициент поглощения. Оптическая плотность.

  5. Оптимальный интервал измеряемых значений оптической плотности (кривая ошибок).

  6. Критерии соблюдения законов поглощения и оценка чувствительности фотометрической реакции. Построение калибровочного графика.
1   2   3   4   5

Похожие:

Спектральные методы исследования в биохимии iconГинекологии для студентов 5 курса
Исследование функции яичников. Дополнительные методы исследования: биопсия, диагностическое выскабливание, аспирационная биопсия,...
Спектральные методы исследования в биохимии iconМетодические рекомендации по изучению дисциплины «Методы исследований...
Целью освоения дисциплины «Методы исследования в социальной работе» является формирование целостной системы знаний об основных общенаучных...
Спектральные методы исследования в биохимии iconПрограмма вступительных экзаменационных испытаний в ординатуру по...
Методы исследования пищевода. Рентгенологические методы. Эзофагоманометрия. Фармакодиагностика. Методы выявления гастроэзофагеального...
Спектральные методы исследования в биохимии iconПояснительная записка Курс «Физико-химические методы исследования»
Курс «Физико-химические методы исследования» преподается в течение 6 семестра (одо), предназначен для магистрантов, обучающихся по...
Спектральные методы исследования в биохимии iconПамятка по подготовке к лабораторным методам исследованиям лабораторные методы исследования
Лабораторные методы исследования служат важным этапом обследования больного. Полученные данные помогают оценке состояния больного,...
Спектральные методы исследования в биохимии iconУчебно-методический комплекс. Рабочая учебная программа для студентов...
А. А. Кудрявцев., С. С. Волкова. Спектральные методы исследования в нефтехимии: Учебно-методический комплекс рабочая учебная программа...
Спектральные методы исследования в биохимии iconПримерная программа наименование дисциплины инструментальные методы исследования почв и растений
Инструментальные методы исследования почв и растений является предшествующей дисциплиной для следующих дисциплин: история и методология...
Спектральные методы исследования в биохимии iconПрограмма для подготовки аспирантов специальности 07. 00. 09 «Историография,...
«Историография, источниковедение и методы исторического исследования» (07. 00. 00 Исторические науки и археология) [Электронный ресурс]...
Спектральные методы исследования в биохимии iconПрограмма вступительных испытаний по направлению подготовки научно-педагогических...
Введение. Биохимия как наука о веществах, входящих в состав живой природы, и их превращениях, лежащих в основе жизненных явлений....
Спектральные методы исследования в биохимии icon«Роль женщины в современном мире»
Введение (аннотация, актуальность, проблема, цель и задачи, предмет и объект исследования, гипотеза и методы исследования)
Спектральные методы исследования в биохимии iconИсследования
Гипотеза: в результате проведённого исследования будут определены последствия воздействия пк на организм человека, указаны методы...
Спектральные методы исследования в биохимии iconТеория, методология и методы психологического исследования
Целью курса является формирование у студентов профессиональной компетентности в области планирования и проведения теоретического...
Спектральные методы исследования в биохимии iconРекомендации по оформлению реферата практикума по курсу
Реферат включает в себя следующие блоки: «введение», «глава I. Обзор литературных источников», «глава II. Цель, задачи, методы, организация...
Спектральные методы исследования в биохимии iconРегуляция I и II типов программированной клеточной гибели т-лимфоцитов...
Работа выполнена в нил биохимии нуклеиновых кислот кафедры биохимии фгаоувпо «Казанский (Приволжский) федеральный университет», г....
Спектральные методы исследования в биохимии iconРич Р. К. Политология. Методы исследования: Пер с англ. / Предисл. А. К. Соколова
Мангейм Дж. Б., Рич Р. К. Политология. Методы исследования: Пер с англ. / Предисл. А. К. Соколова. – М.: Издательство “Весь Мир”,...
Спектральные методы исследования в биохимии iconАналитический обзор по тематике Всероссийской конференции с международным участием
«Фундаментальные и прикладные аспекты исследования симбиотических систем», проведенной в Саратове 25-27 сентября 2007 г в Институте...


Школьные материалы


При копировании материала укажите ссылку © 2013
контакты
100-bal.ru
Поиск