Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с





Скачать 343.24 Kb.
НазваниеРазработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с
страница3/3
Дата публикации21.01.2015
Размер343.24 Kb.
ТипАвтореферат
100-bal.ru > Информатика > Автореферат
1   2   3


W.K. Roth и E. Seifried, (2002) подтвердили ретроспективным анализом отсутствие трансмиссии HCV в течении трёх лет после введения минипул-ПЦР-тестирования в институте Франкфурта на Майне и отсутствие сероконверсии архивных образцов, тестируемых в индивидуальных ПЦР. Сообщение T.J. Legler et al (2000) о том, что тестирование индивидуальных донаций крови на РНК HCV значительно уменьшает остаточный риск HCV- инфицирования по сравнению с минипул- NAT- тестированием, в этой связи является малодоказательным. Вопрос выбора размеров минипулов для NAT-тестирования решается на основе реальной чувствительности (лимита детекции вирусов), которая устанавливается путем тестирования разведений международных стандартов с известной концентрацией HIV, HCV и HBV, концентрирования вирусов в минипуле и определения процента выхода РНК и ДНК в процессе экстракции их из плазмы конкретным методом. В качестве примера можно привести уже упомянутые нами в первой главе данные Японского Красного Креста по минипул-NAT-тестированию донаций крови из 500 и 50 образцов. Поскольку частота NAT-положительных донаций при использовании минипулов из 50 образцов была выше, чем в минипулах из 500 образцов, в настоящее время служба крови Красного Креста Японии проводит NAT-скрининг донорской крови в минипулах из 50 образцов. Такой сравнительный опыт NAT-тестирования донорской крови в минипулах из 4, 8, 10, 12, 16 и 32 образцов был получен и нами. К началу нашей деятельности мы не располагали международными или национальными рабочими стандартами для определения лимита детекции, и мы не имели автоматического самплера для приготовления минипулов из 96 образцов в формате микропланшета. После того, как были созданы международные стандарты на NAT- тестирование HIV, HCV и HBV, появилась реальная возможность осуществить дополнительное NAT- скринирование донорской крови методом минипулов, чтобы уменьшить затраты времени и материалов на тестирование одной донации. В обнаруженном ПЦР-положительном пуле из 96 образцов в микропланшетном формате вирус-содержащая донация определяется путем ретестирования первичных минипулов из 8 и 12 донаций как показано на рис.2 и 3. Однако с учетом небольших объёмов анализируемой донорской крови (в пределах 1000 донаций в месяц) определение вирусов, в основном, проводилось в небольших минипулах из 8 или 10 донаций, как и при исследованиях аналогичного уровня в некоторых зарубежных банках крови. Работа с такими пулами из нескольких образцов целесообразна на первом этапе проведения NAT-тестирования и для СПК, типа нашей, с пропускной способностью около 10000-15000 донаций в год.

Важным этапом организации минипул-NAT-тестирования является обеспечение пулирования плазмы в течение первых суток после получения крови и архивирования исследуемых образцов с целью последующей идентификации NAT-положительных донаций в NAT-положительном минипуле и ретроспективные исследования посттрансфузионных случаев инфицирования реципиентов.

Мы не применяли коммерческие системы для экстракции ДНК и РНК из плазмы или лейкоцитов крови. Наш первый опыт минипул-NAT-тестирования состоялся только благодаря тому, что Н.А. Федоровым и А.А. Ёловым был создан однопробирочный, быстрый способ одновременной экстракции РНК и ДНК с последующей обратной транскрипцией РНК ВИЧ и HCV в полученном осадке НК, что позволило исключить потери их, особенно, очень лабильной РНК. Второй необходимой предпосылкой нашего опыта были in-house ПЦР и РТ-ПЦР тест-системы на ДНК HBV и РНК HIV и HCV, содержащие внутренние стандарты, которые необходимы для исключения ложно-отрицательных результатов NAT-тестирования и для полуколичественной оценки содержания вируса в пробе. Весьма полезной оказались и оригинальная компоновка реагентов в наших ПЦР-тест-системах, поскольку исключена необходимость их хранения в замороженном виде, и получение ПЦР-смесей в пробирке под слоем парафина для проведения ПЦР с горячим стартом. И, наконец, в процессе нашей работы по минипул-NAT-тестированию была апробирована оригинальная видеокомпьютерная установка «Шатёр» для регистрации полученных методом электрофорезной детекции продуктов ПЦР, созданная А.В. Виноградовым и соавт. (ТОО «Дельта-Тех»).

Более 8 000 донаций, исследованные нами методом минипул-NAT-тестирования получены от кадровых доноров плазмы были серонегативные. Вторая группа, более 3 500 донаций, получены от первичных доноров, и ПЦР- и ИФА- тестирование проводили одновременно. В свете наших и литературных данных, частота вирусных маркеров среди первичных доноров, в среднем, на порядок выше, чем среди кадровых серонегативных доноров. Сравнение процента РНК HCV- и ДНК HBV-положительных в этих двух группах доноров показывает, что среди серонегативных доноров было 0, 023% HBV и 0,00% HCV-положительных, подтвержденных при ПЦР-тестировании индивидуальных донаций, а среди первичных доноров было 0, 076-0,09% HBV- и 0,13-0,69% HCV-положительных, подтвержденных при ПЦР-тестировании индивидуальных донаций. Важно отметить, что группа серонегативных доноров в 2,5 раза больше по численности, чем группа первичных доноров, но, тем не менее, среди неё не выявлено ни одной HCV-положительной донации. Такая низкая частота хорошо согласуется с аналогичной частотой среди серонегативных доноров по данным литературы.

На СПК ФУ «Медбиоэкстрем» в инициативном плане совместно с Гепатологическим консультативным центром КЗ г. Москвы (руководитель д.м.н., проф. Н.П. Блохина) создана программа «Клинико-лабораторного исследования доноров с положительными результатами ИФА- и ПЦР- анализов на вирусные гепатиты В и С», имеющая целью изучить возможности реабилитации доноров с положительными реакциями ИФА, но отрицательными результатами ПЦР- анализа на вирусы гепатитов В и С путем комплексного изучения в динамике специфических антител, антигенов, вирусных РНК и ДНК в крови и биоптатах печени, биохимических показателей, функционального состояния печени и клинического статуса. В настоящее время начато формирование трех регистров доноров: с высокими значениями оптической плотности ИФА-анализа на антитела к HCV и HbsAg; серонегативные в ИФА, но положительные на РНК HCV и ДНК HBV; положительные как по результатам ИФА, так и по результатам ПЦР.

По-видимому, лица, серопозитивные, но не содержащие самих вирусов, имеют большую вероятность благоприятных исходов инфекций HCV и HBV. Весьма интересен в этом смысле факт, что уровни АЛТ у HCV ИФА- и ПЦР-положительных доноров были достоверно, в среднем в 3 раза, выше по сравнению с донорами ИФА- позитивными, но ПЦР- отрицательными на РНК HCV (W. K. Roth et al., 2001)
ВЫВОДЫ


  1. Первый российский опыт дополнительного минипул-NAT-тестирования донорской крови на основе отечественных in-house ПЦР тест-систем на РНК HIV, HCV и ДНК HBV дал результаты аналогичные тем, которые были получены при ручном тестировании в других странах.

  2. Частота ПЦР-негативных доноров среди ИФА-положительных составила 45-57 %, что также находится в пределах известных вариаций.

  3. Центрифугирование минипулов при 48 000 g 1 час концентрирует вирус в осадок и снижает эффект разведения при формировании минипулов.

  4. Частота ПЦР-положительных донаций среди первичных доноров на HCV на порядок превышает частоту среди серонегативных кадровых доноров плазмы.

  5. Аналогичный международным NAT-стандарт на HBV, созданный на основе калибровки HBV-положительной плазмы доноров путем последовательных разведений, стабилен в течение нескольких недель в жидком состоянии, и сохраняет исходный уровень при – 200 С в течение нескольких месяцев.

  6. NAT-тестирование ИФА-позитивных доноров позволяет отделять истинных вирусоносителей, что необходимо для проведения эпидемиологических и лечебно-профилактических мероприятий.

  7. Инициирована первая российская программа «Клинико-лабораторного исследования доноров с положительными результатами ИФА- и ПЦР- анализов на вирусные гепатиты В и С» совместно с Гепатологическим Консультативным Центром КЗ г. Москвы. (Руководитель-профессор Н.П. Блохина)


Публикации по теме диссертации


  1. Стандартизация методов генной амплификации и минипул – ПЦР – генотестирование донорской крови, её компонентов и препаратов плазмы на ВИЧ, вирусы гепатитов В, С и ЦМВ// Материалы научно-практической конференции «Актуальные вопросы гематологии и трансфузиологии», Санкт-Петербург, 6-8 июня 2000 года, с. 237-238 (соавт.: Н.А. Федоров, А.А. Елов, Ю.С. Суханов, И.Б. Сущенко)

  2. Повышение вирусной безопасности донорской крови на основе генотестирования// Всероссийская конференция “Методические и практические аспекты фракционирования донорской крови в лечебной практике и донорстве”, г. Москва, ОАО БФА, 28-29 ноября 2000 г. (соавт.: Н.А. Федоров, А.А. Елов, Ю.С. Суханов)

  3. Новые факты об отсутствии клинических симптомов заболеваний у молодых людей, инфицированных вирусами гепатита С// Вестник службы крови России, № 2, май, 2001, с. 37-38 (соавт.: Н.А. Федоров, Е.Н.Федоров, А.А. Елов, Н.П. Блохина, Ю.С. Суханов, И.Б. Сущенко)

  4. Новые данные об отсутствии прогрессирования инфицирования вирусами гепатита С у здоровых молодых людей// Российские медицинские вести, № 2, 2001, с.16-17. (соавт.: Н.А. Федоров, Е.Н.Федоров, А.А. Елов, Н.П. Блохина, Ю.С. Суханов, И.Б. Сущенко)

  5. Первый Российский опыт ручного и полуавтоматического минипул-NAT-тестирования донорской крови на HIV, HCV, HBV// Вестник службы крови России, № 4, 2001 (соавт.: Н.А. Федоров, А.А. Ёлов, Ю.С. Суханов, И.Б. Сущенко)

  6. ПЦР-скринирование донорской крови на ВИЧ, вирусы гепатитов В и С методом минипулов// Трансфузиология, № 4, 2001 (соавт.: Н.А. Федоров, А.А. Ёлов, Ю.С. Суханов, И.Б. Сущенко)

  7. Универсальные технологии для ПЦР- генотестирования крови и других биоматериалов// Сборник трудов научно-практической конференции «Современные проблемы гематологии и трансфузиологии», 2-4 февраля 2002 г. Г. Киров (соавт.: А.А. Елов, Н.А. Федоров, Е.Н. Федоров, Ю.С. Суханов, И.Б. Сущенко)

  8. Разработка технологии параллельного ИФА- и минипул- NAT- тестирования донорской крови на ВИЧ, вирусы гепатитов В и С// Материалы VIII съезда Всероссийского научно-практического общества эпидемиологов, микробиологов и паразитологов «Диагностика, профилактика и лечение инфекционных болезней», 26-28 марта 2002 г., г. Москва (соавт.: А.А. Ёлов, И.Б. Сущенко, Н.А. Фёдоров)

  9. Разработка технологии параллельного ИФА- и минипул- NAT- тестирования донорской крови на ВИЧ, вирусы гепатитов В и С// Русский журнал ВИЧ/СПИД и родственные проблемы, т.6, №1, 2002, С-Петербург, с. 129 (соавт.: А.А. Ёлов, И.Б. Сущенко, Н.А. Фёдоров)

Список сокращений:





ALT

- аланин-аминотрансфераза

Anti-HBc

- антитела к ядерному антигену вируса гепатита В

Anti-HBs

- антитела к поверхностному антигену вируса гепатита В

EPFA

- Европейская Ассоциация фракционирования плазмы

FDA

- организация по контролю за лекарственными препаратами и пищевыми продуктами США

JRC

- Японский Красный Крест

HBsAg

- поверхностный антиген вируса гепатита В

HBV

- вирус гепатита В

HCV

- вирус гепатита С

HIV

- вирус иммунодефицита человека

In house

- тест-системы изготовленные в лаборатории

IVIG

- препараты иммуноглобулинов

NASBA

- амплификация, основанная на последовательности нуклеиновых кислот (аналог амплификации, опосредованной транскрипцией)

NAT

- технологии анализов, основанные на амплификации нуклеиновых кислот

Q-FFP

- плазма подвергнутая карантинизации

SoGAT

- Международная рабочая группа по стандартизации генамплификационных методов исследования

TMA

- амплификация, опосредованная транскрипцией

WHO

- Всемирная организация здравоохранения

Бранч-DNA

- гибридизационный анализ с использованием разветвленных ДНК-зондов

ДНК

- дезоксирибонуклеиновая кислота

ИФА

- иммуноферментный анализ

НК

- нуклеиновая кислота

ПЦР

- полимеразная цепная реакция

РНК

- рибонуклеиновая кислота

РТ-ПЦР

- полимеразная цепная реакция с предварительной обратной транскрипцией рибонуклеиновой кислоты






1   2   3

Похожие:

Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconэпидемиологическая характеристика внутрибольничных гепатитов в и...
Институт эпидемиологии и инфекционных болезней им. Л. В. Громашевского амн украины, заведующий лабораторией вирусных гепатитов и...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconКонспект урока "Группы крови. Переливание крови. Донорство" (Тема...
...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconВозможности лаборатории Центра крови 1-го мгму имени И. М. Сеченова
Обследование доноров: определение hbsAg, антител к вирусу гепатита С, вич, сифилису
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconГородского округа красноуфимск постановление
О внесении изменений в постановление главы городского округа Красноуфимск №43 от 24. 01. 2011 года «Об утверждении комплексного плана...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconАвтор: Лебедева Ольга Дмитриевна Координаты
...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconНазвание урока Ознакомление с окружающим миром
...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconНазвание На ІІ ежегодном Всероссийском Конгрессе по инфекционным...
Разработка нормативной документации, программа по элективным курсам и курсам по выбору учащихся, компьютерной базы
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconСейчас в мире, пожалуй, нет взрослого человека, который не знал бы,...
Вич-инфекция захватила практически все страны. В 2004 году в мире насчитывалось около 40млн вич-инфицированных – примерно 38 млн...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconРеферат по биологии на тему: «Вирусы»
Вирусы живут пока сражаются и погибают от бездействия. Они очень прихотливы к пище, живут «взаймы» за счёт клеток животных, растений...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconКонспект урока. Учитель Филаевская Н. В. Тема урока Графы
...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconКонспект урока биологии в 8 классе Тема урока. Внутренняя среда организма....
Сформировать представление о составе внутренней среды организма, продолжить формирование знаний о составе крови, функциях клеток...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconУрок по вич статистика и история развития эпидемии
Занятие необходимо начать с постановки проблемы: с начала эпидемии спида 64 млн человек в мире были инфицированы вич, 40 млн из них...
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconУчебный модуль
Профилактика вич-инфекции среди пин, лечение и социальное сопровождение с вич/спидом
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconПрограмма по формированию навыков безопасного поведения на дорогах...
Кровь, её состав и значение в обеспечении жизнедеятельности организма. Клеточные элементы крови эритроциты, лейкоциты, тромбоциты....
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconПрограмма профилактики вич-инфекции в общеобразовательном учреждении...
Вич/спида образовательной среде в разработке программ по профилактике вич-инфекции следует руководствоваться принципом многоаспектности....
Разработка технологии параллельного иммуноферментного и генамплификационного (nat) минипул- тестирования донорской крови на вич, вирусы гепатитов в и с iconТема: «Компьютерные вирусы. Свойства и классификация»
Научиться находить компьютерные вирусы с помощью программого обеспечения «Антивирус Касперского 2011»


Школьные материалы


При копировании материала укажите ссылку © 2013
контакты
100-bal.ru
Поиск