Рабочая программа по дисциплине в основы молекулярной биологии

6.1. Контрольные вопросы и задания для проведения текущего контроля для студентов ОФО

1. 
   Определение предмета "молекулярная биология". Этапы развития. Основные открытия.
   
2. 
   Доказательства генетической роли нуклеиновых кислот.
   
3. 
   Хронология открытий, подготовивших создание Уотсоном и Криком модели двойной спирали ДНК.
   
4. 
   Нуклеозид, нуклеотид, полинуклеотид. Нерегулярные полимеры.
   
5. 
   Принципы строения двойной спирали ДНК. Виды ДНК.
   
6. 
   Параметры В-, А- и Z-форм ДНК.
   
7. 
   Виды РНК. Их роль в клетке.
   
8. 
   Классификация аминокислот.
   
9. 
   Первичная и вторичная структура белка.
   
10. 
    Третичная и четвертичная структура белка.
    
11. 
    Глобулярные и фибриллярные белки.
    
12. 
    Денатурация и ренатурация белков.
    
13. 
    Фолдинг белков. Шапероны. Шаперонины. Прионы.
    
14. 
    Основные биологические функции белков.
    
15. 
    Белки ферменты. Понятие о коферментах.
    
16. 
    Белки трансформаторы энергии.
    
17. 
    Регуляторная и рецепторная функции белков.
    
18. 
    Транспортная, питательная и энергетическая функции белков.
    
19. 
    Принципиальное строение биологической мембраны.
    
20. 
    Функции ДНК. Информационная емкость.
    
21. 
    Генетический код. Его основные свойства.
    
22. 
    Принципы транскрипции.
    
23. 
    Субъединичный состав РНК-полимеразы E.coli. Holo- и Core- фермент.
    
24. 
    Понятие об опероне.
    
25. 
    Особенности структуры промоторов у прокариот.
    
26. 
    Этапы транскрипции у прокариот.
    
27. 
    Регуляция транскрипции у бактерий.
    
28. 
    Негативная индукция. Позитивная индукция.
    
29. 
    Негативная репрессия. Позитивная репрессия.
    
30. 
    Аттенуация в регуляции экспрессии триптофанового оперона E.coli.
    
31. 
    Особенности транскрипции у эукариот.
    
32. 
    Множественность и специфичность РНК-полимераз эукариот.
    
33. 
    Понятие об экзонах и интронах .
    
34. 
    Cis-элементы транскрипции. Понятие об энхансерах .
    
35. 
    Trans-факторы транскрипции.
    
36. 
    Образование инициаторного комплекса транскрипции с участием РНК- полимеразы II.
    
37. 
    Процессинг mРНК эукариот:
    
38. 
    Кепирование и полиаденилирование,
    
39. 
    Сплайсинг и редактирование.
    
40. 
    Различные механизмы сплайсинга.
    
41. 
    Автосплайсинг.
    
42. 
    Trans-сплайсинг.
    
43. 
    Альтернативный сплайсинг.
    
44. 
    РНК-интерференция. si РНК. mi РНК.
    
45. 
    Строение иммуноглобулинов, их классификация и функции.
    
46. 
    Переключение классов иммуноглобулинов.
    
47. 
    Источники разнообразия антител.
    
48. 
    V-J рекомбинации при перестройке генов легких цепей иммуноглобулинов.
    
49. 
    V-D-J рекомбинации при перестройке генов тяжелых цепей иммуноглобулинов.
    
50. 
    Структура tРНК.
    
51. 
    Рекогниция. Аминоацилирование tРНК.
    
52. 
    Структура рибосом про- и эукариот. Центры рибосом E.coli.
    
53. 
    Образование инициаторного комплекса трансляции у прокариот.
    
54. 
    Этапы трансляции у прокариот. Белковые факторы трансляции.
    
55. 
    Регуляция трансляции на примере фага MS2.
    
56. 
    Образование rРНК и белков рибосом у E.coli.
    
57. 
    Образование рибосом у эукариот. Понятие о ядрышке.
    
58. 
    Принципы репликации ДНК.
    
59. 
    Доказательство полуконсервативного характера репликации.
    
60. 
    Ферментативная система синтеза ДНК in vitro. Активирование ДНК.
    
61. 
    ДНК-полимераза I из E.coli. Роль 3'®5' и 5'®3' гидролитических
    
62. 
    активностей.
    
63. 
    Схема непрерывной антипараллельной репликации Корнберга.
    
64. 
    Схема непрерывной параллельной репликации Кэрнса.
    
65. 
    Схема прерывистой антипараллельной репликации Оказаки.
    
66. 
    Сравнительная характеристика ДНК-полимераз I, II и III(core) из E.coli.
    
67. 
    ДНК-полимераза III*, holo-фермент. Их функции.
    
68. 
    Схема размножения фага М13 и доказательство наличия РНК-затравки при репликации ДНК.
    
69. 
    Модель «катящегося колеса».
    
70. 
    Праймаза и праймосома.
    
71. 
    Проблема денатурации матрицы при репликации ДНК . SSB. Геликазы.
    
72. 
    Принципы работы и биологические функции топоизомераз.
    
73. 
    Современная схема репликации ДНК E.coli .
    
74. 
    Репликация ДНК аденовируса человека.
    
75. 
    Репликация митохондриальной ДНК млекопитающих.
    
76. 
    Особенности репликации ядерных ДНК эукариот. Полирепликонность.
    
77. 
    Проблема недорепликации 3'-концов линейных молекул.
    
78. 
    Теломеры и теломераза .
    
79. 
    Основные репарабельные повреждения в ДНК и принципы их исправления.
    
80. 
    Общая характеристика гистонов.
    
81. 
    Нуклеосомный, супербидный, петлевой уровни компактизации ДНК эукариот. Метафазная хромосома.
    
82. 
    Геномы и кариотипы. Размеры и количество генов у разных таксонов.
    
83. 
    Гены "домашнего хозяйства" и гены "роскоши".
    
84. 
    Основы метода ренатурации ДНК в изучении структуры генома эукариот.
    
85. 
    Сателлитная ДНК. Особенности состава. Локализация в геноме. Палиндромы. Роль обращенных повторов в геноме.
    
86. 
    Умеренные повторы в геноме. Уники.
    
87. 
    Понятие о мобильных генетических элементах. Классификация мобильных генетических элементов по механизму перемещения.
    
88. 
    Вирус иммунодефицита человека: структура провируса, белки, кодируемые
    вирусом.
    
89. 
    Особенности ретровирусоподобных (LTR-содержащих) ретротранспозонов
    
90. 
    Механизм обратной транскрипции ретровирусов и LTR – содержащих
    ретротранспозонов.
    
91. 
    Ретропозоны, не содержащие LTR (LINE и SINE элементы).
    
92. 
    Особенности организации ДНК-транспозонов. Примеры про- и эукариотических ДНК-транспозонов. Механизм интеграции ДНК-транспозонов в геном.
    
93. 
    Эффекты встройки мобильных элементов. Значение мобильных элементов в эволюции.
    
94. 
    Этапы понимания молекулярных механизмов канцерогенеза.
    
95. 
    Многостадийность опухолевой трансформации. Основные этапы.
    
96. 
    Понятие онкогена и протоонкогена. Вирусные и клеточные онкогены. Ras онкоген, Myc онкоген. Механизмы активации протоонкогенов.
    
97. 
    Гены-супрессоры опухолеобразования.
    
98. 
    Общие принципы клонирования ДНК.
    
99. 
    Гель-электрофоретическое фракционирование нуклеиновых кислот и белков.
    
100. 
     Использование антител для детекции белков. Вестерн-блот.
     
101. 
     Гибридизация нуклеиновых кислот. Саузерн-блот. Нозерн-блот.
     
102. 
     Секвенирование ДНК по Сэнгеру.
     
103. 
     Полимеразная цепная реакция.
     

1. 
   ЭБС « Консультант студента» Жимулёв, И.Ф. Общая и молекулярная генетика : учеб. пособие для вузов / И. Ф. Жимулёв; под ред. Е. С. Беляева, А. П. Акифьева. - Новосибирск: Сиб. унив. изд-во, 2007. - 479 с. - Режим доступа: http://studentlibrary.ru/
   
2. 
   ЭБС « Консультант студента» Принципы и методы биохимии и молекулярной биологии/ редакторы К. Уилсон и Дж. Уолкер ; пер. с англ. - М. : БИНОМ. Лаборатория знаний, 2013. - 848 с - Режим доступа: http://studentlibrary.ru/
   
3. 
   ЭБС « Консультант студента» Степанов, В.М. Молекулярная биология. Структура и функции белков : учебник / В.М. Степанов.. - М. : Изд-во Моск. ун-та : Наука, 2005. -336 с. - Режим доступа: http://studentlibrary.ru/