Исследование ассоциации ряда генов-кандидатов с ишемической болезнью сердца

Таблица 2.
Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера C(–681)G гена PPARG3 в группах “ИБС+” и “ИБС–”.
Аллели и генотипы	Частота аллелей и генотипов		Значение 	Уровень значимости p
	“ИБС+” (n = 313)	“ИБС–“ (n = 132)
Аллель C	0,773	0,788	0,23	0,63
Аллель G	0,227	0,212
Генотип CC	0,601	0,629	0,32	0,85
Генотип CG	0,345	0,318
Генотип GG	0,054	0,053

1.2 Исследование ассоциации полиморфного маркера Gly482Ser гена PPARGC1A с ИБС.

Продукт экспрессии гена PPARGC1A играет ключевую роль в метаболизме клеток миокарда. Активация PGC-1 в миоцитах сердца ведет к индукции генов, кодирующих ферменты системы перекисного окисления липидов (Lehman et al., 2000), а также активирует ряд транскрипционных факторов, таких как ERR, ERR и NRF-1, которые стимулируют биогенез митохондрий и усиливают экспрессию генов, кодирующих компоненты системы переноса электронов в митохондриях (Huss et al., 2004). Белки семейства PGC-1 увеличивают активность транскрипционных факторов путем прямых белок-белковых взаимодействий и, помимо PGC-1, в это семейство входит также коактиваторы PGC-1и PGC-1r (Andersson et al., 2001; Lin et al., 2002; Lin et al., 2005; Finck et al., 2006; Soyal et al., 2006).

PGC-1 и PGC-1экспрессируются в бурой жировой ткани, сердце, скелетных мышцах и почках (Puigserver et al., 1998). Несмотря на относительно большое количество информации об эффектах PGC-1в изолированных миоцитах и модельных системах, о его регуляторной роли в человеческом сердце известно мало. Пока неизвестно, уменьшается ли экспрессия или активность PGC-1 при сердечно-сосудистых патологиях. В гене PPARGC1A обнаружен ряд полиморфных маркеров, которые показали ассоциацию с инсулинорезистентностью и сахарным диабетом типа 2 (Ek et al., 2001; Hara et al., 2002; Andrulionyte et al., 2004; Oberkofler et al., 2004). Однако остается неясным, ассоциированы ли эти полиморфные маркеры с заболеваниями сердечно-сосудистой системы.

Таблица 3.
Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера Gly482Ser гена PPARGC1A в группах “ИБС+” и “ИБС–”.
Аллели и генотипы	Частота аллелей и генотипов		Значение 	Уровень значимости p
	“ИБС+” (n = 313)	“ИБС–“ (n = 132)
Аллель Gly	0,671	0,667	0,02	0,90
Аллель Ser	0,329	0,333
Генотип Gly/Gly	0,431	0,409	0,56	0,76
Генотип Gly/Ser	0,479	0,515
Генотип Ser/Ser	0,089	0,076

В нашей работе мы использовали полиморфный маркер Gly482Ser гена PPARGC1A, расположенный в экзоне 8. Ряд новых исследований показал ассоциацию этого полиморфизма с сердечно сосудистыми патологиями при сахарном диабете типа 2 (Lai et al., 2008) и гипертонией (Andersen et al., 2005; Xie et al., 2007). Данные по изучению ассоциации этого полиморфного маркера с ИБС отсутствуют.

В нашей работе при исследовании распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера Gly482Ser гена PPARGC1A в группах “ИБС+” и “ИБС–” статистически достоверных различий получено не было (табл. 3). Таким образом, полиморфный маркер Gly482Ser гена PPARGC1A не ассоциирован с развитием ИБС у русских г. Москвы.
1.3. Исследование ассоциации полиморфного маркера T(–87)C гена PPARD c ИБС.

Белки семейства PPAR регулируют экспрессию генов с помощью связывания с регуляторными элементами в промоторных областях генов. Необходимым кофактором для них является рецептор ретиноидов Х (RXR) и активность комплекса PPAR/RXR зависит от доступности лигандов для PPAR и RXR. Наиболее значимыми эндогенными лигандами для семейства PPAR являются длинноцепочечные жирные кислоты и их метаболиты. До недавних пор изоформы PPAR/δ были мало изучены. PPAR/δ экспрессируются во всех тканях тела, но в миоцитах наблюдается повышенный уровень экспрессии (Gilde et al., 2003). Было показано, что изоформы PPAR/δ защищают миоциты от апоптоза, вызванного окислительным стрессом, с помощью увеличения экспрессии каталазы, которая разлагает перикись водорода (Pesant et al., 2006).

В гене PPARD обнаружен ряд полиморфизмов, для одного из которых, а именно
T(–87)C, показана ассоциация с сахарным диабетом типа 2 (Andrulionyte et al., 2006), инсулинорезистентностью (Hu et al., 2006), метаболическим синдромом (Robitaille et al., 2007) и уровнем липопротеинов высокой плотности (Aberle et al., 2006).

Полиморфизм T(–87)C (также известен под обозначением T294C) находится в промоторной области гена PPARD на расстоянии 87 нуклеотидов от точки инициации трансляции. Было обнаружено, что этот полиморфизм оказывает влияние на связывание транскрипционного фактора Sp-1 и аллель С ассоциирован с повышенной транскрипционной активностью (Skogsberg et al., 2003). В этом же исследовании было установлено, что аллель С полиморфного маркера T(–87)C гена PPARD ассоциирован с пониженным уровнем липопротеинов низкой плотности, в то время как другие полиморфные маркеры (C(–409)T, C73T и A255G) не показали ассоциации с уровнями липопротеинов высокой и низкой плотности. В связи с этим в нашем исследовании мы анализировали полиморфный маркер T(–87)C гена PPARD, как наиболее вероятный функционально значимый полиморфизм промоторной области.

Таблица 4.
Сравнительный анализ распределения частот аллелей и генотипов полиморфного маркера T(–87)C гена PPARD в группах “ИБС+” и “ИБС–”.
Аллели и генотипы	Частота аллелей и генотипов		Значение 	Уровень значимости p	OR [CI 95%]
	“ИБС+” (n = 313)	“ИБС–“ (n = 132)
Аллель T	0,347	0,432	5,77	0,02	0,70 [0,52 – 0,94]
Аллель C	0,653	0,568			1,43 [1,07 – 1,92]
Генотип TT	0,281	0,258	29,24	4,7 · 10-7	–
Генотип TC	0,131	0,348			0,28 [0,17 – 0,46]
Генотип CC	0,588	0,394			2,19 [1,45 – 3,32]