Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор» Информационный мониторинг эпидемиологической ситуации по оови в мире и России Бюллетень №5

Рисунок 2 Цепи передачи во время вспышки заболевания, вызванного вирусом Эбола, в Гвинее. Показаны цепи передачи во время вспышки заболевания, вызванного вирусом Эбола, включая лабораторно подтвержденные случаи. Предполагаемые пути передачи вируса Эбола Заир (EBOV), выявленные путем эпидемиологического исследования, показаны сплошными стрелками. Пунктирные стрелки означают, что эпидемиологические связи не установлены. Лабораторно подтвержденные случаи (C) обозначены красными кружками, а случаи подозрения (S) указаны вместе с номерами пациентов. Изображение на вставке - скан гвинейского штамма EBOV в крови пациента, выполненный с помощью электронного микроскопа. Показаны типичная целая вирусная частица, концы которой помечены стрелками, и две разрушенные частицы (концы стрелок) (масштаб -100 нм). Деревня Мелианду, Гекеду 9 летальных исходов с 2 декабря 2013 года по 8 февраля 2014 года 2 летальных исхода 26 марта 2014 года Первые случаи заболевания, зарегистрированные во время вспышки (S1) Ребенок в возрасте 2 лет Лихорадка, черный стул, рвота Начало 2 декабря 2013 года; умер 6 декабря 2013 года Деревня Данду Помбо, Гекеду 6 летальных исходов с 11 февраля по 31 марта 2014 года (S13) Член семьи, уход за S6 Лихорадка, кровоизлияния Начало 4 февраля 2014 года; смерть наступила 11 февраля 2014 года Деревня Гбанду, Гекеду 3 летальных исхода с 9 марта по 12 марта 2014 года (S2) Сестра S1, в возрасте 3 лет Лихорадка, черный жидкий стул, рвота Начало 25 декабря 2013 года; умерла 29 декабря 2013 года (S3) Мать S1 и S2 Кровотечение Умерла 13 декабря 2013 года (S4) Бабушка S1 и S2 Лихорадка, диарея, рвота Умерла 1 января 2014 года (S5) Медсестра Лихорадка, диарея, рвота Начало 29 января 2014 года; умерла 2 февраля 2014 года (S6) Деревенская акушерка Лихорадка Госпитализирована в Гекеду 25 января 2014 года; Умерла 2 февраля 2014 года Деревня Дава, Гекеду 8 летальных исхода с 26 января по 27 марта 2014 года (S7) Сестра S4, присутствовала на похоронах S4 Лихорадка, диарея, рвота, кровоизлияния Начало 20 января 2014 года; умерла 26 января 2014 года (S8) присутствие на похоронах S4 Лихорадка, кровотечение Начало 25 января 2014 года; смерть наступила 30 января 2014 года (S9–S12) Начало 2–16 февраля 2014 года; смерть наступила 11 февраля – 5 марта 2014 года Гекеду S6 Район Баладу Гекеду Начало 23 февраля 2014 года 14 летальных исходов с 1 марта по 31 марта 2014 года Район Фарако Гекеду Начало 24 февраля 2014 года 4 летальных исхода с 28 февраля по 25 марта 2014 года Теща (или свекровь) S14; умерла 22 марта 2014 года Члены семьи S14 Медицинский работник в больнице Гекеду Лихорадка, диарея, рвота Начало 5 февраля 2014 года Ездила в больницу Масенты; Умерла 10 февраля 2014 года Киссидугу 5 летальных исходов с 7 марта по 26 марта 2014 года (S16) Брат S15 Лихорадка, рвота Начало 24 февраля 2014 года; умер 7 марта 2014 года (S17) Брат S15 Лихорадка, рвота, икота Начало 24 февраля 2014 года; переведен ил больницы Гекеду в Киссидугу; умер 8 марта 2014 года Масента 15 летальных исходов с 10 февраля по 29 марта 2014 года (S15) Врач больницы в Масента; ухаживал за S14 Рвота, кровотечение, икота Начало 19 февраля 2014 года; умер 24 февраля 2014 года Похороны в Киссидугу Контакт с S15 и зараженными членами семьи S15 Начало 3 марта 2014 года; умер 12 марта 2014 года Еще 2 смертельных случая в семье Член семьи S15 и контакт с S14 Умер 28 февраля 2014 года в Нзерекоре Контакт с C12 в Масенте Госпитализирован в Масенте 6 марта 2014 года Умер 16 марта 2014 года в Нзерекоре Секвенирование образцов от пациентов EBOV в образцах, полученных от трех пациентов, был полностью секвенирован с помощью обычного метода Сэнгера (регистрационные номера в GenBank KJ660346, KJ660347 и KJ660348). Три последовательности, каждая длиной 18959 нуклеотидов, были идентичны за исключением нескольких полиморфизмов в позициях 2124 (G→A, синонимичный), 2185 (A→G, глицин NP552→глутаминовая кислота), 2931 (A→G, синонимичный), 4340 (C→T, синонимичный), 6909 (A→T, аргинин sGP291→триптофан) и 9923 (T→C, синонимичный). Гвинейский штамм EBOV продемонстрировал 97% идентичность со штаммами EBOV из Демократической Республики Конго и Габона. Филогенетический анализ полноразмерных последовательностей посредством байесовского метода и метода максимального правдоподобия показал, что гвинейский EBOV занимает отдельное, базальное положение в кладе EBOV(Рис. 3). Клинический и эпидемиологический анализ Выраженными клиническими признаками инфекции EBOV в подтвержденных случаях были лихорадка, тяжелая диарея и рвота; кровоизлияния отмечались реже. Летальность в первых случаях составила 86% (12 из 14 больных с известным исходом умерли). Подтвержденные случаи имели место в больницах префектур Гекеду, Масента, Нзерекор и Киссидугу (Рис. 1). Мы провели эпидемиологическое ретроспективное исследование цепей передачи путем анализа больничной документации и интервью с пострадавшими семьями, пациентами с подозрением на заболевание и жителями деревень, в которых произошли случаи заболевания. В соответствии с последними результатами эпидемиологического исследования, первый случай подозрения на заболевание во время вспышки был у 2-летнего ребенка, который умер в Мелианду, префектура Гекеду, 6 декабря 2013 года (Рис. 2). Пациент S14, медицинский работник из Гекеду с подозрением на заболевание, по-видимому, стал источником распространения вируса в Масенте, Нзерекоре и Киссидугу в феврале 2014 года. По мере распространения вируса 13 из подтвержденных случаев могли быть связаны с четырьмя кластерами: район Баладу в Гекеду, район Фарако в Гекеду, Масента и Киссидугу. В конечном итоге, все кластеры были связаны с несколькими смертельными случаями в деревнях Мелианду и Дава с декабря 2013 по март 2014 года. Текущее состояние продолжающейся вспышки В данном отчете рассматриваются начальный этап и географическое происхождение вспышки EBOV. До конца марта 2014 года (неделя 13) в префектурах Гекеду, Масента и Киссидугу было зарегистрировано в общей сложности 111 случаев подозрения на заболевание на основе клинических признаков и 79 смертельных случаев (уровень летальности 71% на основе клинических подозрений). В соответствии со сроками в цепях передачи (Рис. 2), вспышка подтвержденного заболевания началась в префектуре Гекеду, а затем распространилась в Масенту и Киссидугу (Рис. 4). Соотношение мужчин и женщин среди умерших пациентов составило 41:59; средний возраст составил 35 лет (межквартильный интервал 25-51). Рисунок 3. Филогенетический анализ рода Ebolavirus, включая штаммы EBOV из Гвинеи. Филогенетическое дерево было выведено методом Монте-Карло с байесовским подходом и цепью Маркова. Второе дерево, которое было выведено для того же набора последовательностей методом максимального правдоподобия, подтвердило дерево, полученное байесовским методом (данные не приводятся). Байесовские задние вероятности и бутстраповские проценты (1000 повторов в дереве, полученном методом максимального правдоподобия) показаны на ветвях. Для простоты представления ветви для видов, не являющихся EBOV, были сокращены и сжаты (ветви, показанные пунктирными линиями). Регистрационный номер в GenBank, обозначение штамма, страна происхождения и год выделения указаны на ветвях EBOV. Гвинейский штамм EBOV доступен в European Virus Archive (www.european-virus-archive.com/). Обсуждение В данном исследовании описано возникновение EBOV в Гвинее. Высокая степень сходства между 15 частичными последовательностями гена L наряду с тремя полноразмерными последовательностями и эпидемиологические связи между случаями заболевания наводят на мысль об однократном вторжении вируса в человеческую популяцию. По-видимому, это вторжение произошло в начале декабря 2013 года или даже раньше. Продолжается эпидемиологическое исследование с целью определения животного - предполагаемого источника вспышки. Имеется подозрение, что вирус передавался в течение нескольких месяцев до того, как вспышка проявила себя в виде кластеров случаев в больницах Гекеду и Масенты. Подобная длительность воздействия, видимо, создала условия для многих цепей передачи и, таким образом, увеличила число случаев заболевания, вызванного вирусом Эбола. Клиническая картина первых случаев включала преимущественно лихорадку, рвоту и тяжелую диарею. У большинства пациентов с подтвержденным заболеванием не было кровоизлияний на момент отбора проб, но, возможно, они появились на более поздних стадиях заболевания. Термин «заболевание, вызванное вирусом Эбола» (а не «геморрагическая лихорадка Эбола) указывает на то, что кровоизлияния отмечались не у всех пациентов15, и может помочь врачам и руководителям здравоохранения в раннем распознавании заболевания. Уровень летальности составил 86% для первых подтвержденных случаев и 71% для случаев подозрения на основе клинических признаков, что согласуется с уровнями летальности, наблюдавшимися во время предыдущих вспышек EBOV.15-17 Филогенетический анализ полноразмерных последовательностей установил наличие отдельной клады гвинейского штамма EBOV, находящейся в сестринских отношениях с другими известными штаммами EBOV. Это наводит на мысль о том, что штамм EBOV из Гвинеи эволюционировал параллельно со штаммами из Демократической Республики Конго и Габона от недавнего предка, а не был занесен из этих стран в Гвинею. Потенциальные резервуары EBOV, фруктовые летучие мыши видов Hypsignathus monstrosus, Epomops franqueti и Myonycteris torquata, присутствуют на обширных территориях Западной Африки.18 Возможно, EBOV в течение какого-то времени циркулировал в этом регионе, оставаясь не выявленным. Появление вируса в Гвинее подчеркивает риск возникновения вспышек EBOV во всем западноафриканском субрегионе. Исследование проводилось при поддержке гранта (228292, European Virus Archive) Европейского сообщества. Национальный референтный центр вирусных геморрагических лихорадок (National Reference Center for Viral Hemorrhagic Fevers) в Лионе, Франция, поддерживается Национальным институтом санитарного надзора (Institut National de Veille Sanitaire). Формы раскрытия информации, предоставленные авторами, доступны с полным текстом этой статьи на сайте NEJM.org. Мы благодарим Celine Nezan, Roberto de la Tour, Véronique Pinot, Frédéric Lautram и Sallia Swarray за помощь в получении образцов и их транспортировке из Гвинеи в Европу; Stephanie Mundweiler, Alexandra Fizet, Jean-Michel Thiberge, Laure Diancourt, Sonja Maersmann, Elisa Pallasch, Britta Liedigk и Hendrik Herrmann за техническую помощь в выявлении, секвенировании и визуализации вируса с помощью электронной микроскопии; Caesar Munoz-Fontela за предоставление праймеров для секвенирования EBOV; Boubacar Diallo за управление данными и Francis Mulemba за материально-техническую поддержку при подготовке рукописи. Рисунок 4. Количество случаев подозрения на заболевание, вызванное вирусом Эбола, по префектурам и неделям. Случаи заболевания в префектурах Гекеду, Масента и Киссидугу были зарегистрированы местными органами здравоохранения в сотрудничестве с Всемирной организацией здравоохранения и организацией «Врачи без границ». На рисунках: выжившие умершие A Гекеду (80 случаев подозрения с 59 смертельными случаями) Неделя B Масента (23 случая подозрения с 15 смертельными случаями)

Похожие:

	Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Геморрагическая лихорадка Эбола в Юго-Западной Африке (Ситуация на 21. 04. 2014 года)		Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Сообщение от президента Медицинского отделения Техасского университета 23 марта 2013 года
	Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Двадцать четыре (24) пациента в настоящее время находятся в Центрах лечения evd: Конакри (6), Guéckédou (9), Telimele (3) и Boffa...		Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Оперативная информация о болезни, вызванной вирусом Эбола (бввэ) в Западной Африке на сайте воз
	Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Каскадная регуляция экспрессии генов вируса осповакцины модулируется многоступенчатыми промоторами. Yang Z, Maruri-Avidal L, Sisler...		Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Заявление воз по итогам совещания Комитета Международных медико-санитарных правил по чрезвычайной ситуации в отношении вспышки Эболы...
	Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Нейтрализующие антитела, связанные с факторами воздействия ортопоксвирусов у работников лабораторий. Neutralizing antibodies associated...		Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Компания Bavarian Nordic получает разрешение на продажу оспенной вакцины imvanex в Европе (Bavarian Nordic Receives European Marketing...
	Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... Юго-Восточной Гвинеи (районы Гуэкеду, Масента и Киссидугу). Семеро заболевших в настоящее время проходят лечение в изоляторах района...		Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «вектор»... «Ликвидация оспы: уничтожение запасов вируса натуральной оспы». В подготовленном к сессии докладе Секретариата воз2 представлена...
	Получение антигенов и использование их для разработки средств диагностики... Работа выполнена в Федеральном государственном учреждении науки Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии «Вектор»...		29 марта 2012 года Дата введения Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор"; Федеральным казенным учреждением здравоохранения "Противочумный...
	Информационный бюллетень №15 (конкурсы, гранты, конференции) Ноябрь 2006 Содержание: «Горящие» Центрально-черноземный региональный информационный центр научно-технологического сотрудничества с ес		Информационный бюллетень №10. (конкурсы, гранты, конференции) Июнь... Центрально-черноземный региональный информационный центр по научно-технологическому сотрудничеству с ес
	Информационный бюллетень №13. (конкурсы, гранты, конференции) Сентябрь... Центрально-черноземный региональный информационный центр по научно-технологическому сотрудничеству с ес		Информационный бюллетень №7. (конкурсы, гранты, конференции) Апрель... Центрально-черноземный региональный информационный центр по научно-технологическому сотрудничеству с ес