Методические указания по самостоятельной работе Красноярск

Применение кредитно-рейтинговой системы по дисциплине «Компьютерные технологии в биологии»

Основной целью применения кредитно-рейтинговой системы по дисциплине «Компьютерные технологии в биологии» является повышение эффективности оценки качества аудиторной и самостоятельной работы студентов за счет объективного измерения результатов работы студентов. Трудоемкость отдельных модулей и других видов учебной работы (промежуточный контроль, написание реферата) по дисциплине оценивается в относительных единицах и представлена в Приложении 3.

Кредитно-рейтинговая система по дисциплине «Компьютерные технологии в биологии» базируется на следующих принципах:

1. Контроль всех видов учебной деятельности, включая аудиторную и самостоятельную работу студента.

2. Осуществление внутренней и внешней коррекции результатов обучения.

3. Индивидуальное планирование последующих этапов изучения дисциплины.

4. Комплексное использование различных форм опроса (устный опрос, письменный опрос, тестирование, собеседование, взаимоконтроль и т. д.).

К основным задачам применения кредитно-рейтинговой системы по дисциплине «Компьютерные технологии в биологии» относятся:

• 
  развитие личностных качеств студента (способность к саморазвитию, направленность на самоактуализацию, самореализацию и самоутверждение; повышение состязательности в учебе; активизация самостоятельной работы);
  
• 
  формирование особенностей самоорганизации и самоуправления в образовательном процессе (самоконтроль, самооценка, планирование и прогнозирование диапазона уровня знаний, выбор студентом личной образовательной траектории);
  
• 
  создание комфортных условий для учебы (сведение до минимума случайности при сдаче экзамена и зачета, так как оцениваются все результаты, достигнутые в период обучения; снижение экзаменационного стресса).
  

Применяемая в дисциплине «Компьютерные технологии в биологии» модель рейтинговой системы оценивания, построенная по модульному принципу, предполагает систематическую подготовку студентов к занятиям, так как происходит оценивание результатов каждого вида учебной работы.

По результатам промежуточных аттестаций студенту засчитывается трудоемкость дисциплины в зачетных единицах и выставляется дифференцированная оценка по 100-балльной шкале, которая характеризует качество освоения студентом знаний, умений и навыков по данной дисциплине. Стобальная шкала основывается на распределении трудоемкости в процентном соотношении между текущей работой студента в семестре − 50 % и аттестацией − 50 %.

Таблица трудоемкости модулей и видов учебной работы в относительных единицах приведена в прил. 3.

По отдельным видам трудоемкость распределена следующим образом:

6 % – посещаемость лекционных занятий для обеспечения непосредственного контакта преподавателя при изучении теоретического материала и определения направленности самостоятельной работы;

20 % – выполнение заданий на практических занятиях в связи с практической направленностью дисциплины;

24 % – выполнение самостоятельных работ;

50 % – сдача зачета.

Нагрузка студента при изучении дисциплины «Компьютерные технологии в биологии» распределена максимально планомерно. Это необходимо для того, чтобы студент мог оптимально реализовывать как учебную, так и научную работу, связанную с изучением данной дисциплины. Также в рекомендациях устанавливается график выполнения и проверки всех видов работы, преподаватель должен вовремя выдавать и проверять задания для самостоятельной работы.

Посещение лекций не приносит студентам значительное количество баллов, но является условием успешной сдачи зачета и практических заданий, поскольку на лекциях освещаются наиболее сложные проблемы курса, дается информация о новых направления и тенденциях развития современной науки.

После выполнения всех этих видов учебной работы в семестре и получения определенного количества зачетных единиц (минимум оставляет 0,5 от максимально возможного количества зачетных единиц в семестре), студент допускается к сдаче зачета.

7 Учебно-методические материалы по дисциплине

Список литературы:

Основной:

1. 
   Суковатый, А. Г. Информационно-коммуникационные технологии в образовании : учеб. пособие / А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая, К. Н. Захарьин. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 177 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в образовании : УМКД № 167-2007 / рук. творч. коллектива А. Г. Суковатый).
   
2. 
   Несен А.В. Microsoft Word 2010: от новичка к профессионалу – "ДМК Пресс", 2011 – 448 стр. Режим доступа: http://e.lanbook.com/books/element.php?pl1_cid=25&pl1_id=1210 или http://www.znanium.com/catalog.php?item=booksearch&code=Microsoft%20Office%20#
   
3. 
   Журавлева И. В. Оформляем документы на персональном компьютере: грамотно и красиво: ГОСТ Р.6.30-2003. / И.В. Журавлева, М.В. Журавлева. - М.: ИНФРА-М, 2008. - 187 с. Режим доступа: http://www.znanium.com/catalog.php?item=booksearch&code=Microsoft%20Office%20#
   
4. 
   Теория вероятностей и математическая статистика: Учебное пособие / С.В. Павлов. - М.: ИЦ РИОР: ИНФРА-М, 2010. - 186 с. Режим доступа: http://www.znanium.com/bookread.php?book=217167#none
   
5. 
   Кудрявцев Е.М. Mathcad 11: Полное руководство по русской версии – "ДМК Пресс", 2009 – 592 стр. Режим доступа: http://e.lanbook.com/books/element.php?pl1_cid=25&pl1_id=1172
   
6. 
   Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : учеб. пособие / И. Е. Суковатая, А. Г. Суковатый, В. А. Кратасюк, К. Н. Захарьин. – Красноярск : ИПК СФУ, 2009. – 178 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : УМКД № 1363/991–2008 / рук. творч. коллектива И. Е. Суковатая).
   
7. 
   Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : лаб. практикум / И. Е. Суковатая, А. Г. Суковатый, К. Н. Захарьин, В. А. Кратасюк. – Красноярск : ИПК СФУ, 2009. – 92 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : УМКД № 1363/991–2008 / рук. творч. коллектива И. Е. Суковатая).
   
8. 
   Информационно-коммуникационные технологии в образовании : лаб. практикум / А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая, К. Н. Захарьин. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 78 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в образовании : УМКД № 167-2007 / рук. творч. коллектива
   А. Г. Суковатый).
   
9. 
   Информационно-коммуникационные технологии в образовании : метод. указания к практ. занятиям / сост. : А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая, К. Н. Захарьин. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 20 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в образовании : УМКД № 167-2007 / рук. творч. коллектива А. Г. Суковатый).
   
10. 
    Bioinformatics, Volume II: Structure, Function and Applications, edited by Jonathan M. Keith, 2008 Humana Press, a part of Springer Science+Business Media, LLC. – Режим доступа: http://www.springer.com/life+sciences/systems+biology+and+bioinformatics/book/978-1-60327-428-9
    
11. 
    Bioinformaticsa: concept-based introduction, edited by Venkatarajan Subramanian Mathura, Pandjassarame Kangueane, Springer Science+Business Media, LLC 2009 – Режим доступа: www.springer.com
    
12. 
    Frederick, B. Marcus. Bioinformatics and Systems Biology: Collaborative Research and Resources, 2008, Springer-Verlag Berlin Heidelberg. – Режим доступа: www.springer.com
    
13. 
    Bioinformatics: Applications in Life and Environmental Sciences, edited by M.H. Fulekar, 2009, Capital Publishing Company Copublished by Springer, P.O. Box 17, 3300 AA Dordrecht, The Netherlands with Capital Publishing Company, New Delhi, India. – Режим доступа: www.springer.com.
    
14. 
    Bioinformatics for DNA Sequence Analysis, edited by David Posada, Humana Press, a part of Springer Science, Business Media, LLC 2009– Режим доступа: www.springer.com.
    
15. 
    Remote Instrumentation for eScience and Related Aspects, edited by Franco Davoli, Marcin Lawenda, Norbert Meyer, Roberto Pugliese, Jan Węglarz, Sandro Zappatore / Springer Science+Business Media, LLC. 2012, – 305 p. – Режим доступа: www.springer.com.
    
16. 
    Computational Systems Biology, 2009, Humana Press Inc. – Режим доступа: www.springer.com.
    
17. 
    Computational Biology, Series: Methods in Molecular Biology, Vol. 673 Fenyö, David (Ed.) 1st Edition., XI, 327 p. 2010. – Режим доступа: http://www.springer.com/life+sciences/systems+biology+and+bioinformatics/book/978-1-60761-841-6.
    
18. 
    Alexander Isaev. Introduction to Mathematic Methods in Bioinformatics, Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2006. – Режим доступа: www.springer.com.
    
19. 
    Visualization in Medicine and Life Sciences II, Progress and New Challenges, editors: Lars Linsen, Hans Hagen, Bernd Hamann, Hans-Christian Hege, 2012, Springer Science-HBusiness Media, LLC. – Режим доступа: http://link.springer.com/book/10.1007/978-3-642-21608-4/page/1.
    
20. 
    Marshall, S. Smith. Opening Education // Science. – 2009. – № 323. –
    P. 89–93.
    
21. 
    Jung-jae Kimand Dietrich Rebholz-Schuhmann. Categorization of services for seeking information in biomedical literature: a typology for improvement of practice, BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS. 2008. – VOL 9. – NO 6. P. 452–465
    
22. 
    Benson, D. A. GenBank / D. A. Benson, I. Karsch-Mizrachi, D. J. Lipman, J. Ostell , D. L. Wheeler // Nucleic Acids Research. – 2008. – 36. – D. 25–30.
    
23. 
    Fink, J. L. BioLit: integrating biological literature with databases /
    J. Fink L., Kushch S., Williams P. R., Bourne P. E. // Nucleic Acids Research. – 2008. – 36. – W. 385–389.
    
24. 
    Wheeler, D. L. Database resources of the National Center for Biotechnology Information / D. L. Wheeler, T. Barrett, D. A. Benson [etc.] // Nucleic Acids Res. – 2008. – 36. – D13–D21.
    
25. 
    E-инструментарий в биомедицинских исследованиях: учеб. пособие / сост. А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая, Е. И. Шишацкая. – Красноярск : ООО «Дарма», 2012. – 177 с.;
    
26. 
    Применение информационно-коммуникационных технологий в биомедицине : методические указания по лабораторных работам / сост. А. Г. Суковатый, И. Е. Су-коватая – Красноярск : ООО «Дарма», 2012. – 19 с.;
    

Дополнительная литература

27. 
    Foster, I. Service-Oriented Science / Foster I. // Science. – 2005. –
    308. – P. 814–817.
    
28. 
    Hey, T. Cyberinfrastructure for E-Science / T. Hey, A. E. Trefethen // Science. – 2005. – 308. – P. 817–821.
    
29. 
    Johnson, J. L. Distance Education: The Complete Guide to Design, Delivery, and Improvement / J. L. Johnson. – New York : Teachers College Press. – 2003. – 230 p.
    
30. 
    Buetow, K. H. Cyberinfrastructure : Empowering a «Third Way» in Biomedical Research / K. H. Buetow // Science. – 2005. – 308. – P. 821–824.
    
31. 
    Collins, L. M. Collaborative eScience libraries / L. M. Collins,
    M. L. B. Martinez, K. K. Mane, J. E. Powell, C. M. Kieffer, T. Simas,
    S. K. Heckethorn, K. R. Varjabedian, M. E. Blake, R. E. Luce // Int J Digit Libr. – 2007. – 7. – P. 31–33.
    
32. 
    Cyberinfrastructure Vision for 21st Century Discovery. – National Science Foundation Cyberinfrastructure Council. – March 2007. – Режим доступа: http://scholcommbc.blogspot.com/2007/04/cyberinfrastructure-vision-for-21st.html.
    
33. 
    Konagaya, A. Trends in life science grid: from computing grid to knowledge grid / A. Konagaya // BMC Bioinformatics. – 2006. – 7. – (Suppl 5).
    
34. 
    Leontis, N. B. The RNA Ontology Consortium: An open invitation to the RNA community / N. B. Leontis, R. B. Altman, H. M. Berman // RNA. – 2006. – 12. – P. 533–541.
    
35. 
    Luciano, J. S. E-Science and biological pathway semantics /
    J. S.Luciano, R. D. Stevens // BMC Bioinformatics. – 2007. – 8.
    
36. 
    Rajkumar, B. Grid Computing: Making the Global Cyberinfrastructure for eScience a Reality / Rajkumar B. // CSI Communications. – 2005. – 29. – 1. –
    P. 6–8.
    
37. 
    Szalay, A. The World-Wide Telescope/ A. Szalay, J. Gray // Science. – 2001. – 293. – P. 2037–2040.
    
38. 
    Применение информационно-коммуникационных технологий в образовании : учеб.-метод. пособие / А. В. Сарафанов, А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая и др. – Красноярск : ИПЦ КГТУ, 2006 (3 экз.)
    
39. 
    Интерактивные технологии в дистанционном обучении : учеб.-метод. пособие / А. В. Сарафанов, А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая и др. – Красноярск, ИПЦ КГТУ, 2006 (3 экз.)
    
40. 
    Bioinformatics methods and protocols/ edited by Stephen Misener and Stephen A. Krawetz 2000 Humana Press Inc. – Режим доступа: www.springer.com.
    
41. 
    Wolstencroft, K. Protein classification using ontology classification /
    K. Wolstencroft, P. Lord, L. Tabernero, A. Brass, R. Stevens // Bioinformatics. – 2006. – 22. – 14. – P. 530–538.Рубин, А. Б. Биофизика / А. Б. Рубин. Т. 1–2. – М. : МГУ, 1999.
    
42. 
    Фотобиофизика : учеб. пособие / В. А. Кратасюк, И. Е. Суковатая, Е. В. Немцева и др. – Красноярск : ИПК СФУ, 2007. – 413 с. – (Фотобиофизика : УМКД № 141-2007 / рук. творч. коллектива В. А. Кратасюк).
    
43. 
    Николаев, А. Я. Биологическая химия : учебник / А. Я. Николаев. – 3-е изд., перераб. и доп. – М. : Медицинское информационное агентство, 2007. – 568 с.
    
44. 
    СТО 4.2-07–2008. Система менеджмента качества. Общие требования к построению, изложению и оформлению документов учебной и научной деятельности / разраб. : Т. В. Сильченко, Л. В. Белошапко, В. К. Младенцева, М. И. Губанова. – Введ. впервые 09.12.2008. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 47 с.
    
45. 
    Каталог лицензионных программных продуктов, используемых в СФУ / сост. : А. В. Сарафанов, М. М. Торопов. – Красноярск : Сиб. федер. ун-т; 2008. – Вып. 3.
    
46. 
    Абрамов, С. М. Отечественные СуперЭВМ и грид-системы /
    С. М. Абрамов, В. Ф. Заднепровский, А. А. Московский // Проблемы развития национальной киберинфраструктуры в России : XII науч.-практ. конф. ун-та г. Переславля. – 2008.
    
47. 
    Интернет-образование: не миф, а реальность XXI века / Ж. Н. Зайцева, Ю. Б. Рубин, Л. Г. Титарев и др. ; под общ. ред. В. П. Тихомирова. –
    М. : МЭСИ, 2000. – 189 с.
    
48. 
    Левицкий, А. А. Подготовка учебных материалов для использования в образовательном процессе с применением дистанционных технологий: учеб.-метод. пособие / А. А. Левицкий, А. В. Сарафанов, А. В. Толстоногов, С. И. Трегубов. – Красноярск : ИПЦ КГТУ, 2003. – 43 с.
    
49. 
    Масич, А. Г. Аспекты развития коммуникаций / А. Г. Масич,
    Г. Ф. Масич // XIV конф. представителей рег. науч.-образ. сетей «RELARN-2007».
    
50. 
    Мицель, А. А. Дистанционное образование как составляющая процесса формирования единого образовательного пространства / А. А. Мицель, Е. В. Молнина // Открытое образование. – 2006. – № 2. – С. 59–65.
    
51. 
    Норенков, И. П. Информационные технологии в образовании / И. П. Норенков, А. М. Зимин. – М.: МГТУ им. Н. Э. Баумана, 2004. – 352 с.
    
52. 
    Осин, А. В. Мультимедиа в образовании: контекст информатизации / А. В. Осин. – М. : Ритм, 2005. – 320 с.
    
53. 
    Осин, А. В. Мультимедиа в образовании: контекст информа-тизации / А. В. Осин. – М. : Издат. сервис, 2004. – 320 с.
    
54. 
    Terence, C. Ahern, The effect of social grounding on collaboration in a computer-mediated small group discussion / C. Ahern Terence, A. Thomas Julie, K. Tallent-Runnels Mary, Y. Lan William, Cooper Sandra, Lu Xiaoming, Cyrus Jacqui // Internet and Higher Education. – 2006. – 9. – P. 37–46.
    
55. 
    Alfred, P. Rovai. Student evaluation of teaching in the virtual and traditional classrooms: A comparative analysis / Alfred P. Rovai, Michael K. Ponto, M. Gail Derrick, John M. Davis // Internet and Higher Education.– 2006. – 9. - P. 23–35.
    
56. 
    Bairoch, A. The ENZYME database in 2000 / A. Bairoch // Nucleic Acids Res. 2000. – 28. P. 304–305.
    
57. 
    Berriz1, G. F. The Synergizer service for translating gene, protein and other biological identifiers./ Berriz1 G. F., Roth F. P. // Bioinformatics. 2008.  24. 19. – P. 2272–2273.
    
58. 
    Cotton, D. Reflecting on the think-aloud method for evaluating E-Learning. / Cotton Deborah, Gresty Karen // British Journal of Educational Technology. – 2006. – 37(1). – P. 45–54.
    
59. 
    Donello, J. F. Theory and practice: Learning content management systems / J. F. Donello // E-Learning magazine. – 2002.
    
60. 
    Robert, Ellis A. Discontinuities in university student experiences of learning through discussions. / Ellis Robert A., Calvo Rafael A. // British Journal of Educational Technology. – 2006. – 37(1). – P. 55–65.
    
61. 
    Gulamali, M.Y. GENIE: Delivering E-Science to the environmental scientist. / M. Y. Gulamali, , T. M. Lenton, A. Yool [etc].  UK E-Science All Hands Meeting.  Nottingham, UK.  Sep. 2003.  P. 145–152. – Режим доступа: http://www.genie.ac.uk/publications/papers.htm.
    
62. 
    Gregory, Hislopa W. A study of faculty effort in online teaching / Hislopa Gregory W., Ellis Heidi J. C. // Internet and Higher Education. – 2004. – 7. – P. 15–31.
    
63. 
    Kanehisa, M. The KEGG resource for deciphering the genome./ Kanehisa, M., Goto, S., Kawashima, S., Okuno, Y., Hattori, M.// Nucleic Acids Res. - 2004. – 32. – D. 277–280.
    
64. 
    Langstona, Marc. Linking to journal articles in an online teaching environment: The persistent link, DOI, and OpenURL / Marc Langstona, James Tyler// Internet and Higher Education. – 2004. – 7. – P. 51–58.
    
65. 
    Schlosser, Lee Ayers. Distance Education: Definition and Glossary of Terms: the monograph / Lee Ayers Schlosser, Michael Simonson. – Definitions and Terminology Committee Association for Educational Communications and Technology Bloomington (AECT), 2002.
    
66. 
    Luther, A. Alchemi: A .NET-Based Enterprise Grid Computing System / A. Luther, R. Buyya, R. Ranjan, S. Venugopal // Proceedings of the 6th International Conference on Internet Computing (ICOMP'05).  June 2730. – 2005.  Las Vegas, USA. – Режим доступа: http://www.alchemi.net.
    
67. 
    Luther, A. Peer-to-Peer Grid Computing and a .NET-based Alchemi Framework / A. Luther, R. Buyya, R. Ranjan, S. Venugopal ; editors  Laurence Yang and Minyi Guo.  New Jersey, USA : Wiley Press : High Performance Computing: Paradigm and Infrastructure.  2005.
    
68. 
    Martone, M. E. e-Neuroscience: challenges and triumphs in integrating distributed data from molecules to brains / M. E. Martone, A. Gupta, M. H. Ellisman // Nature Neuroscience.  2004. – 7. – P. 467 – 472.
    
69. 
    Mukamusoni, D. Distance Learning Program of Teachers’ at Kigali Institute of Education: An expository study. / D. Mukamusoni // International Review of Research in Open and Distance Learning. – 2006. – 7(2).
    
70. 
    Parsons Sarah. The use of ICT by adults with learning disabilities in day and residential services / Parsons Sarah, Daniels Harry, Porter Jill, Robertson Christopher // British Journal of Educational Technology. – 2006. – 37(1). – P. 31–44.
    
71. 
    Stapleton, P. The Web as a source of unconventional research materials in second language academic writing / P. Stapleton, R. Helms-Park, P. Radia // Internet and Higher Education. – 2006. – P. 63–75.
    
72. 
    Optimisation of integrated Earth System Model components using Grid-enabled data management and computation / A. R. Price, G. Xue, A. Yool [etc] // Concurrency and Computation: Practice and Experience.  2007. – 19. – 2. –
    P. 153165. – Режим доступа: http://www.genie.ac.uk/publications/papers.htm.
    
73. 
    Hämäläinen, R. Learning to collaborate: Designing collaboration in a 3-D game environment» / Raija Hämäläinen, Tony Manninen, Sanna Järvelä, Päivi Häkkinen // Internet and Higher Education. – 2006. – 9. – P. 47–61.
    
74. 
    Student evaluation of teaching in the virtual and traditionalclassrooms:
    A comparative analysis / Alfred P. Rovai, Michael K. Ponton, M. Gail Derrick, John M. Davis // Internet and Higher Education. – 2006. – 9. – P. 23–35.
    
75. 
    Improving online learning: Student perceptions of useful and challenging characteristics / Liyan Song, Ernise S. Singleton, Janette R. Hill, Myung Hwa Koh// Internet and Higher Education. – 2004. – 7. – P. 59–70.
    
76. 
    Gnare: automated system for high-throughput genome analysis with grid computational backend / D. Sulakhe, A. Rodriguez, M. D'Souza [etc] // J. Clin. Monit. Comput.  2005.  19. – P. 361369.
    
77. 
    Tatusova, T. A. Complete genomes in WWW Entrez: data representation and analysis / T. A. Tatusova, I. Karsch-Mizrachi, J. A. Ostell // Bioinformatics. – 1999. – 15. – P. 536543.
    
78. 
    Truman, Sylvia M. An investigation of the situated learnability effects of single- and dual-modal systems in education: a report of music-oriented learning environment and science computer-assisted teaching studies / Sylvia M. Truman, Philip J. Truman // British Journal of Educational Technology. – 2006. – 37(1). – P. 131–142.
    
79. 
    Wilson, C. Concerns of instructors delivering distance learning via the WWW / C. Wilson // Online Journal of Distance Learning Administration. – 1(3).– Режим доступа: http://www.westga.edu/~distance/wilson13.html.
    
80. 
    Muller, Hans-Michael. Sternberg Textpresso: An Ontology-Based Information Retrieval and Extraction System for Biological Literature PLoS Biology November. / Hans-Michael Muller, Eimear E. Kenny, Paul W.  2004. V. 2.  Issue 11.  19841998. – Режим доступа: www.plosbiology.org
    

Информационные ресурсы

81. 
    Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях [Электронный ресурс] : электрон. учеб.-метод. комплекс по дисциплине / И. Е. Суковатая, А. Г. Суковатый, В. А. Кратасюк, К. Н. Захарьин. – Электрон. дан. ( 148 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2009. – (Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : УМКД № 1363/991–2008 / рук. творч. коллектива И. Е. Суковатая). – 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или аналогичный процессор других производителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памя-ти ; 208 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; операционная система Microsoft Windows XP SP 2 / Vista (32 бит) ; Adobe Reader 7.0 (или аналогичный продукт для чтения файлов формата pdf) ; Microsoft PowerPoint 2003 или выше. – (Номер гос. регистрации в ФГУП НТЦ «Информрегистр» 0320902487).
    
82. 
    Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях. Банк тестовых заданий [Электронный ресурс] : контрольно-измерительные материалы / И. Е. Суковатая, А. Г. Суковатый, В. А. Кратасюк, К. Н. Захарьин. – Электрон. дан. (43 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2009. – (Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : УМКД № 1363/991–2008 / рук. творч. коллектива И. Е. Суковатая). – 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или аналогичный процессор других про-изводителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памяти ; 103 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; операционная система Microsoft Windows XP SP 2 / Vista (32 бит) ; Adobe Reader 7.0 (или аналогичный продукт для чтения файлов формата pdf). – (Номер гос. регистрации в ФГУП НТЦ «Информрегистр» 0320902489).
    
83. 
    Информационно-коммуникационные технологии в образовании. Версия 1.1 [Электронный ресурс] : электрон. учеб.-метод. комплекс /
    А. Г. Суковатый, И. Е. Суковатая, К. Н. Захарьин. – Электрон. дан. (1380 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – (Информационно-коммуникационные технологии в образовании : УМКД № 167-2007 / рук. творч. коллектива
    А. Г. Суковатый). – 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или аналогичный процессор других производителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памяти ; 800 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; Adobe Reader 7.0 (или аналогичный продукт для чтения файлов формата pdf).
    
84. 
    Фотобиофизика. Версия 1.0 [Электронный ресурс] : электрон. учеб.-метод. комплекс по дисциплине / И. Е. Суковатая, В. А. Кратасюк, В. В. Межевикин и др. – Электрон. дан. (177 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – (Фотобиофизика : УМКД № 141-2007 / рук. творч. коллектива
    В. А. Кратасюк). – 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или аналогичный процессор других производителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памяти ; 96 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; операционная система Microsoft Windows 2000 SP 4 / XP SP 2 / Vista (32 бита) ; Adobe Reader 7.0 (или аналогичный продукт для чтения файлов формата pdf) ; Microsoft PowerPoint 2003 или выше. – (Номер гос. регистрации в ФГУП НТЦ «Информрегистр» 0320802751 от 22.12.2008).
    
85. 
    Унифицированная система компьютерной проверки знаний тестированием UniTest : руководство пользователя / А. Н. Шниперов, Б. М. Бидус.– Красноярск : ИПЦ КГТУ, 2006. – 80 с.
    
86. 
    Виртуальная обсерватория  Virtual Observatory. – Режим доступа: (http://www.worldwidetelescope.org/)
    
87. 
    Европейская лаборатория молекулярной биологии  European Molecular Biology Laboratory Nucleotide Sequence Database in Europe (EMBL). – Режим доступа: http://www.ebi.ac.uk/embl.
    
88. 
    Интернет-портал по Grid-технологиям. – Режим доступа: http://www.gridclub.ru/
    
89. 
    Исследовательский совет Управления науки и технологии Великобритании Research Councils at the Office of Science and Technology (OST). – Режим доступа: http://www.sciencemag.org/feature/misc/webfeat/vis2008/
    
90. 
    Крупнейшая астрономическая электронная библиотека  Astrophysics Data System (ADS). – Режим доступа: http://adswww.harvard.edu/
    
91. 
    Научная электронная библиотека e-Library. – Режим доступа: http://www.elibrary.ru/defaultx.asp.
    
92. 
    Национальная лаборатория Argonne (Argonne National Laboratory) – Режим доступа: http://wit.mcs.anl.gov/WIT2.
    
93. 
    Национальная медицинская лаборатория США, Национального института здоровья США (US National Institutes of Health (NIH)  National Library of Medicine (NLM) – Режим доступа: http://www.nlm.nih.gov/
    
94. 
    Национальный институт здоровья США  US National Institutes of Health (NIH). – Режим доступа: http://www.nih.gov.
    
95. 
    Национальный центр по биотехнологической информации  отдел в Национальной медицинской лаборатории (National Library of Medicine (NLM)), Национального института здоровья США (US National Institutes of Health (NIH)  National Center for Biotechnology Information (NCBI)). – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov.
    
96. 
    Национальный центр по биотехнологической информации (National Center for Biotechnology Information (NCBI)). – Режим доступа: www.ncbi.nlm.nih.gov
    
97. 
    Оригами ДНК. – Режим доступа: http://www.sanger.ac.uk/
    Teams/Team104.
    
98. 
    Программа NASA  Earth Observing System. – Режим доступа: http://nasa.gov.
    
99. 
    Программа в открытом доступе для проведения научных исследований в области биотехнологии  nanoXplorer IDE. – Режим доступа: http://nanotitan.com/index.htm
    
100. 
     Сайт виртуальных обсерваторий. – Режим доступа: http://www.interquanta.biz/vos/
     
101. 
     Система WIT (What is there). – Режим доступа: http://wit.mcs.anl.gov/WIT2.
     
102. 
     Совет по научным исследованиям Великобритании  Research Councils UK. – Режим доступа: http://www.rcuk.ac.uk/default.htm «YourGenome.org». – Режим доступа: http://www.yourgenome.org.
     
103. 
     AT&T Learning Network. – Режим доступа: http://www.att.coin/
     learning_network.
     
104. 
     Barry Willis. Distance Education at a Glance. Guide № 10. – Режим доступа: www.uidacho.edu/eo/index.html.
     
105. 
     Berkeley Digital Library SunSITE. – Режим доступа: http://sunsite.berkeley.edu.
     
106. 
     BioCreAtIvE. – Режим доступа: http://biocreative.sourceforge.net/
     
107. 
     British Educational Communications and Technology agency. – Режим доступа: www.becta.org.uk.
     
108. 
     British Journal of Educational Technology. – Режим доступа: http://www.blackwellpublishing.com/journal.asp?ref=0007-1013&site=1.
     
109. 
     CERN – Европейская организация ядерных исследований (European Organization for Nuclear Research) – Режим доступа: www.cern.ch.
     
110. 
     Chandra X-ray Observatory. – Режим доступа: http://chandra.harvard.edu/about/index.html
     
111. 
     Distance Education and Training Council. – Режим доступа: http://www.detc.org/.
     
112. 
     Distance-educator.com. – Режим доступа: http://www.distance-educator.com/.
     
113. 
     ECMA (European Association for Standardizing Information & Computer Systems)  Европейская ассоциация по стандартизации информационных и вычислительных систем (Женева, Швейцария). – Режим доступа: http://www.ecma.ch.
     
114. 
     Educational Resources Information Center. – Режим доступа: www.askeric.org.
     
115. 
     Education-line. – Режим доступа: http://www.leeds.ac.uk/educol/.
     
116. 
     EDUCOM: Transforming Education Through Information Technolog.– Режим доступа: http://www.educom.edu/.
     
117. 
     Enabling Grids for E-Science (EGEE) – «Развертывание гридов для развития е-науки» – Режим доступа: http://www.eu-egee.org.
     
118. 
     European Journal of Engineering Education.– Режим доступа: http://www.tandf.co.uk/journals/titles/03043797.asp.
     
119. 
     GenBank – Режим доступа: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Genbank/
     index.html.
     
120. 
     Global SchoolNet Foundation Home Page. – Режим доступа: http://www.gsn.org.
     
121. 
     Globus Web Site. – Режим доступа: http://www.globus.org.
     
122. 
     INES (система обработки и распространения данных астрономического архива) – Режим доступа: http://sdc.laeff.inta.es/ines.
     
123. 
     Integrated Genomics Inc. – Режим доступа: http://wit.Integrated Genomics.com/IGwit.
     
124. 
     Interactive Teaching Networ. – Режим доступа: http://www.coe.uga.edu/itn.
     
125. 
     Intercultural E-Mail Classroom Connections. – Режим доступа: http://wwwstolaf.edu/network/iecc.
     
126. 
     International Journal of Computer-Supported Collaborative Learning.– Режим доступа: http://www.springer.com/east/home/education?SGWID=5-40406-70-52582798-0.
     
127. 
     Learning, Media & Technology – Режим доступа: http://www.tandf.co.uk/journals/titles/1463631X.asp.
     
128. 
     MonALISA: an agent based, dynamic service system to monitor, control and optimize grid based applications – Режим доступа: http://monalisa.cacr.caltech.edu
     
129. 
     nanoXplorer IDE – Режим доступа: http://nanotitan.com/index.htm
     
130. 
     National Library of Medicine (NLM) DTD– Режим доступа: http://dtd.nlm.nih.gov.
     
131. 
     NetDay National. – Режим доступа: http://www.netday.org.
     
132. 
     Newsweek Distance Learnin. – Режим доступа: http://www.newsweekdistancelearning.com/index.ph.
     
133. 
     ONLINE EDUCA. – Режим доступа: http://www.onlme-educa.com/.
     
134. 
     Online Journal of Distance Learning Administration. – Режим доступа: http://www.westga.edu/~distance/.
     
135. 
     On-Line Partners Program. – Режим доступа: http://www.cep.yale.
     edu/projects/online.html.
     
136. 
     Open Science Grid (OSG) – Открытый научный Grid. – Режим доступа: http://www.opensciencegrid.org.
     
137. 
     Physical Sciences Center. – Режим доступа: http://www.heacademy.ac.uk/physsci.
     
138. 
     PlanetLab. – Режим доступа: http://www.planet-lab.org.
     
139. 
     Prometric. – Режим доступа: http://www.prometric.com.
     
140. 
     Protein Data Bank (PDB). – Режим доступа: http://www.pdb.org/pdb/home/home.do.
     
141. 
     Protein Structure Initiative. – Режим доступа: http://www.nigms.
     nih.gov/Initiatives/PSI.
     
142. 
     PubMed Central. – Режим доступа: ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov
     /pub/pmc.
     
143. 
     Purdue University’s NanoHub. – Режим доступа: http://www.nanohub.org.
     
144. 
     SourceForge. – Режим доступа: http://sourceforge.net.
     
145. 
     Structural Genomics Knowledgebase. – Режим доступа: http://kb.psi-structuralgenomics.org/KB.
     
146. 
     Structural Genomics Knowledgebase. – Режим доступа: http://kb.psi-structuralgenomics.org/KB.
     
147. 
     The American Center for Study of Distance Education. – Режим доступа: http://www.ed.psu.edu/ACSDE.
     
148. 
     The American Journal of Distance Education. – Режим доступа: http://www.ed.psu.edu/ACSDE/ajde/your.asp.
     
149. 
     The Biomedical Informatics Research Network (BIRN). – Режим доступа: http://www.nbirn.net/
     
150. 
     The British Education. – Режим доступа: http://www.leeds.ac.uk/bei/bei.htm.
     
151. 
     The Computing Research Association (CRA). – Режим доступа: http://www.cra.org
     
152. 
     The Department of Energy’s Earth System Grid (ESG). – Режим доступа: http://www.earthsystemgrid.org.
     
153. 
     The GENIE Project  Grid ENabled Integrated Earth system model. – Режим доступа: www.genie.ac.uk.
     
154. 
     The London E-Science Centre. – Режим доступа: http://www.lesc.ic.ac.uk/admin/escience.html.
     
155. 
     The National Science Foundation’s Network for Earthquake Engineering Simulation (NEES). – Режим доступа: http://it.nees.org.
     
156. 
     The National Science Foundation’s TeraGrid. – Режим доступа: http://www.teragrid.org.
     
157. 
     Trust Genome Campus, институт Trust Sanger Institute в Центре Franklin Centre for Public Engagement. – Режим доступа: http://www.sanger.ac.uk/Teams/Team104.
     
158. 
     UK myGrid project. – Режим доступа: http://www.mygrid.org.uk/ http://www.ebi.ac.uk/mygrid.
     
159. 
     VizieR (наиболее полная база данных астрономических каталогов и таблиц данных). – Режим доступа: http://vizier.u-strasbg.fr.
     
160. 
     Washington University Genome Sequencing Center. – Режим доступа: http://genome.wustl.edu/index.cgi.
     
161. 
     World Development Reports. World Bank. – Режим доступа: http://www.worlbank.org.
     
162. 
     World Wide Web foundation. – Режим доступа: http://www.webfoundation.org.
     
163. 
     Worldwide LHC Computing Grid collaboration (WLCG) – Всемирная коллаборация по вычислительным гридам для LHC. – Режим доступа: http://www.cern.ch/lcg.
     
164. 
     Биоинформационный сервер Argonne GNARE system (GeNome Analysis and Research Environment. – Режим доступа: http://compbio.mcs.anl.gov/gnare/gnare_home.cgi.
     

Перечень наглядных и других пособий, методических указаний и материалов к техническим средствам обучения

165. 
     Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях. Презентационные материалы [Электронный ресурс] : наглядное пособие / И. Е. Суковатая, А. Г. Суковатый. – Электрон. дан. (18 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2009. – (Информационно-коммуникационные технологии в естественнонаучных исследованиях : УМКД № 1363/991–2008 / рук. творч. коллектива И. Е. Суковатая). – 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или аналогичный процессор других производителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памяти ; 18 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; операционная система Microsoft Windows XP SP 2 / Vista (32 бит) ; Adobe Reader 7.0 (или аналогичный продукт для чтения файлов формата pdf). – (Номер гос. регистрации в ФГУП НТЦ «Информрегистр» 0320902488). Интерактивные технические средства обучения: практическое руководство / сост. : А. Г. Суковатый, К. Н. Захарьин, А. В. Казанцев, А. В. Сарафанов. – Красноярск : ИПК СФУ, 2009. – 84 с.
     
166. 
     Захарьин, К. Н. Электронные презентационные материалы /
     А. В. Сарафанов, К. Н. Захарьин, А. Г. Суковатый. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 36 с.
     
167. 
     Информационно-коммуникационные технологии в образовании. Презентационные материалы : учеб. пособие / А. Г. Суковатый,
     И. Е. Суковатая, К. Н. Захарьин. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 178 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в образовании : УМКД
     № 167-2007 / рук. творч. коллектива А. Г. Суковатый).
     
168. 
     Фотобиофизика. Презентационные материалы. Версия 1.0 [Электронный ресурс] : наглядное пособие / И. Е. Суковатая, В. А. Кратасюк, В. В. Межевикин и др. – Электрон. дан. (33 Мб). – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – (Фотобиофизика : УМКД № 141-2007 / рук. творч. коллектива В. А. Кратасюк). – 1 электрон. опт. диск (DVD). – Систем. требования : Intel Pentium (или аналогичный процессор других производителей) 1 ГГц ; 512 Мб оперативной памяти ; 33 Мб свободного дискового пространства ; привод DVD ; операционная система Microsoft Windows 2000 SP 4 / XP SP 2 / Vista (32 бита) ; Microsoft PowerPoint 2003 или выше. – (Номер гос. регистрации в ФГУП НТЦ «Информрегистр» 0320802753 от 22.12.2008).
     
169. 
     Информационно-коммуникационные технологии в образовании : метод. указания по самостоятельной работе / сост. : А. Г. Суковатый,
     И. Е. Суковатая, К. Н. Захарьин. – Красноярск : ИПК СФУ, 2008. – 16 с. – (Информационно-коммуникационные технологии в образовании : УМКД № 167-2007 / рук. творч. коллектива А. Г. Суковатый).
     

Приложение 1

ГРАФИК

учебного процесса и самостоятельной работы студентов по дисциплине «Компьютерные технологии в биологии» направления 020400.68 «Биология» института ИФБиБТ 6 курса на 11 семестр

Наименование дисциплины

Семестр

Число часов аудиторных занятий

Форма контроля

Часов на самостоятельную работу

Недели учебного процесса семестра

Всего

По видам

Всего

По видам

1

2

3

4

5

6

7

8

«Компьютерные технологии в биологии»

11

16

Практические занятия – 16

зачет

ПЗ

ПЗ

ПЗ

ПЗ

ПЗ

ПЗ

ПЗ

ПЗ

20

ТО – 4

ТО

ТО

ТО

ТО

П – 16

ВП

ВП

ВП

ВП

ВП

ВП

ВП

ЗП

Условные обозначения: ТО – изучение теоретического курса; ПЗ – практические занятия; П – проект; ВП – выдача задания на подготовку проект; ЗП – защита проекта

Заведующий кафедрой: ___________ В.А. Кратасюк

Директор института: _____________ В.А. Сапожников

«_______» _______________________ 201_г