5.3. Название тем лекций и количество часов по семестрам изучения учебной дисциплины (модуля)
Раздел (блок), тема учебной дисциплины,
содержание темы (тематический план)
| VII или VIII семестр
| Раздел 1. Методы молекулярной диагностики
|
| Тема 1.1. Методы экстракции нуклеиновых кислот (ДНК, РНК).
1.2. Методы детекции точковых мутаций.
1.3. Секвенирование ДНК: история развития метода, основные принципы.
1.4. Капиллярный электрофорез и фрагментный анализ
| 6
| Раздел 2. Основы молекулярной эволюции.
|
| Тема 2.1. Понятие молекулярной эволюции
2.2. Технические аспекты исследования ископаемых организмов (выделение ДНК из трудных источников)
2.3. Подходы к оценке изменения генов.
| 6
| Раздел 3. Генетика патологических пристрастий
|
| Тема 3.1. Биологические основы предрасположенности к вредным привычкам
3.1.1. Генетические факторы предрасположенности к акоголизму.
3.1.2. Факторы предрасположенности к наркомании и патологическому пристрастию к азартным играм.
| 6
| Раздел 4. Технологии геномного анализа
|
| Тема 4.1. Современные подходы к анализу генома.
4.1.1. Компаративная геномная гибридизация (CGH). 4.1.2.Современные высокопроизводительные методы секвенирования.
4.1.3. Применение чипов в молекулярной биологии и медицине: диагностические и исследовательские задачи.
4.1.4. ДНК, кДНК, протеиновые чипы. Биоинформатические подходы к анализу данных.
| 6
| Итого
| 24
|
5.4. Практические занятия
№ п/п
| № раздела дисциплины
| Тематика практических занятий (лабораторных практикумов)
| Трудоемкость (час.)
| 1.
| Методы экстракции нуклеиновых кислот (ДНК, РНК). Капиллярный электрофорез и фрагментный анализ. Секвенирование ДНК
| Знакомство с методами выделения нуклеиновых кислот
| 4
| 2.
| Методы анализа мутаций
| 4
| 3.
| Лабораторный практикум (постановка полимеразной цепной реакции, анализ результатов; капиллярный электрофорез)
| 4
| 4.
| Основы молекулярной эволюции
| Понятие молекулярной эволюции
| 4
| 5.
| Технические аспекты исследования ископаемых организмов (выделение ДНК из трудных источников)
| 4
| 6.
| Подходы к оценке изменения генов
| 4
| 7.
| Генетические основы предрасположенности к вредным привычкам
| Биологические основы предрасположенности к вредным привычкам
| 4
| 8.
| Генетические факторы предрасположенности к акоголизму
| 4
| 9.
| Факторы предрасположенности к наркомании и патологическому пристрастию к азартным играм
| 4
| 10.
| Современные подходы к анализу генома
| Компаративная геномная гибридизация (CGH)
| 4
| 11.
| Современные высокопроизводительные методы секвенирования
| 4
| 12.
| Применение чипов в молекулярной биологии и медицине: диагностические и исследовательские задачи
| 4
|
5.5.Лабораторный практикум – отдельно не предусмотрен (проводится в структуре практических занятий)
5.6. Семинары – не предусмотрены
ОЦЕНОЧНЫЕ СРЕДСТВА ДЛЯ КОНТРОЛЯ УСПЕВАЕМОСТИ И РЕЗУЛЬТАТОВ ОСВОЕНИЯ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ
6.1. Виды контроля и аттестации, формы оценочных средств
Предусмотрен входящий тестовый контроль, текущий тестовый контроль, итоговый контроль (по 5-балльной оценочной школе).
6.2. Примеры оценочных средств (см. раздел II «БАНК КОНТРОЛЬНЫХ ВОПРОСОВ И ЗАДАНИЙ»)
САМОСТОЯТЕЛЬНАЯ РАБОТА СТУДЕНТОВ
7.1. Виды СРС
№№
разделов, тем
дисциплины (см. учебный план, табл. разд.3.3)
|
Виды самостоятельной работы (СРС)
| Формы
контроля
СРС
| Объём,
часов
| 1
| Внеаудиторная
Аудиторная
| текущий контроль знаний студентов
| 6
| 2
| Внеаудиторная, аудиторная
(подготовка реферата)
| текущий контроль знаний студентов,
доклад по реферату
| 6
| 3
| Внеаудиторная
| текущий контроль знаний студентов;
текущий (тестовый)
контроль;
| 6
| 4
|
Внеаудиторная аудиторная
| итоговый контроль
| 6
| Итого
|
|
| 24
|
Примерная тематика рефератов, курсовых работ, контрольных вопросов
Строение нуклеиновых кислот. Основные информационные процессы – транскрипция, сплайсинг, трансляция. Генетический код.
Геномика, цели, подходы, основные достижения и их значение для развития молекулярной медицины. Структура генома человека. Число генов. Процент сходства по нуклеотидным последовательностям ДНК. Соотношение между кодирующими и некодирующими последовательностями. Изменчивость генома.
Методы экстракции нуклеиновых кислот.
Полимеразная цепная реакция. Цели использования. Необходимые реактивы. Принципы, последовательные этапы метода. Технические условия проведения реакции и ее достоинства. Организация ПЦР-лаборатории.
Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени. Возможности.
Методы детекции точковых мутаций.
Секвенирование. Капиллярный электрофорез.
Выделение ДНК из трудных источников.
Сравнение ДНК разных видов организмов в аспекте молекулярной эволюции.
Роль некодирующих последовательностей ДНК в эволюции.
Генетическая предрасположенность к курению.
Генетическая предрасположенность к алкоголизму.
Генетическая предрасположенность к наркомании и азартным играм.
Высокопроизводительные аналитические подходы в современной биологии и медицине.
Сравнительная геномная гибридизация.
Исследование профилей экспрессии генов.
8. УЧЕБНО-МЕТОДИЧЕСКОЕ И ИНФОРМАЦИОННОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ
8.1. Основная литература 1. Бочков Н.П. Клиническая генетика: 2-ое издание М.: ГЭОТАР-МЕД, 2004. -
448 с.
2. Вахарловский В. Г., Горбунова В. Н. Клиническая генетика. Методическое
пособие. Из-во СПбГПМА. - 2007. - 35 с.
3. Горбунова В. Н. Молекулярные основы медицинской генетики. Под ред. Е.
И. Шварца.- СПб.: «Интермедика», 1999. - 210 с.
4. Имянитов Е. Н., Горбунова В. Н. Генетика канцерогенеза. Методическое
пособие. Из-во СПбГПМА, 2007. - 30 с.
5. Стрекалов Д. Л. Молекулярные основы патогенеза сердечно-сосудистых
заболеваний // Учебное пособие. – СПбГПМА. - 2004. - 21 с.
6. Имянитов Е.Н., Хансон К.П. Молекулярная онкология: клинические аспекты. Издательский дом СПбМАПО, 2007. – 211 с. 8.2. Дополнительная литература
Горбунова В.Н. Что вы знаете о своем геноме? СПб., «Интермедика», 2001. – 144 с.
Стрекалов Д.Л. и соавт. Определение генетической предрасположенности к
некоторым мультифакториальным заболеваниям. Генетический паспорт//
Методические рекомендации. СПб.: ИКФ «Фолиант», 2001. – 48 с.
Козлова С.И. и соавт. Наследственные синдромы и медико-генетическое консультирование. Л., «Медицина», 1996.
Тератология человека. Под ред. Г.И. Лазюка. М.: «Медицина», 1991.
Климов А.Н., Никульчева Н.Г. Обмен липидов и липопротеидов и его нарушения. СПб.: «Питер Ком». - 1999.
Баранов В.С., Баранова А.В., Иващенко Т. Э., Асеев М. В. Геном человека и гены предрасположенности. СПб.:«Интермедика».2001.
Интернет-ресурсы: http://ghr.nlm.nih.gov/ (Genetics Home Reference), http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/ (US National Library of Medicine National Institutes of Health)
9. МАТЕРИАЛЬНО-ТЕХНИЧЕСКОЕ ОБЕСПЕЧЕНИЕ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ 1) Лаборатории: лаборатория ДНК-диагностики, учебная лаборатория по цитогенетике, учебная лаборатория для практических занятий;
2) Лекционные аудитории, оборудованные мультимедийной аппаратурой;
3) Компьютерный класс, оснащенный локальной сетью и выходом в сеть Интернет (компьютерная диагностическая программа по наследственным болезням; иллюстрированные лекции по медицинской генетике для студентов; иллюстративный материал по наследственным болезням обмена; иллюстративный материал по хромосомным болезням;
4) Таблицы, плакаты по различным темам курса.
Наименование специализированных аудиторий и лабораторий1
| Перечень оборудования
| Примечание*
| Необходимое
| Фактическое наличие
| 1
| 2
| 3
| 4
| Ауд. № 1
«Для практических занятий»
|
| 1. Доска - 1
2. Оверхед - 1
3. Проектор - 1
4. Стол - 10
5. Стулья -21
| Показ недостающих наглядных примеров
по заболеваниям
| Ауд. № 2
«Лекционная аудитория»
| 1. Мултимедиа - 1
2. Ноутбук - 1
| 1. Доска - 1
2. Стол - 10
3. Стулья -10
|
| Лаборатория ПЦР-диагностики
|
| 1.Амплификатор - 5
2. Центрифуга - 2
3.Аппарат для э/ф -2
4.Автоматические дозаторы -10
5. Транс-иллюминатор - 1
6. Холодильник - 1
7. Выпрямитель - 1
8. Лаб. столы - 5
9. Лаб. шкафы - 5
10. Секвенатор - 1
|
| Учебная лаборатория по цитогенетике
|
| 1. Термостат - 1
2. Микроскоп
инвертир. - 1
3. Ламинар -1
4. Микроскоп
«Leica» - 1
|
| Преподавательская
|
| 1. Столы - 4
2. Стулья - 4
3. Шкаф плат. – 1
4. Шкаф книжн.- 1
5. Тумбочки - 2
|
| Кабинет заведующего
|
| 1. Столы - 2
2. Стулья - 2
3. Шкаф плат. – 1
4. Шкаф книжн.- 1
5. Компьютер Omni
Book - 1
|
| ОБРАЗОВАТЕЛЬНЫЕ ТЕХНОЛОГИИ
Демонстрация мультимедийных презентаций по тематическим модулям;
Демонстрация методов молекулярной диагностики;
Самостоятельное выполнение молекулярно-генетических методик; анализ и интерпретация результатов;
Участие в студенческой научной работе, участие в общекафедральных научных проектах;
Участие в подготовке публикаций, стендовых докладов, устных докладов на научных конференциях, семинарах, симпозиумах и т.п.
РАЗДЕЛЫ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ И МЕЖДИСЦИПЛИНАРНЫЕ СВЯЗИ С ПОСЛЕДУЮЩИМИ ДИСЦИПЛИНАМИ
№ п/п
| Наименование обеспечиваемых
(последующих) дисциплин
| № разделов (модулей) данной дисциплины, необходимых для изучения обеспечиваемых (последующих) дисциплин
| 1
| 2
| 3
| 4
|
| 1
| Химия
| +
|
|
|
|
| 2
| Медицинская информатика
| +
|
| +
| +
|
| 3
| Биохимия
| +
|
| +
| +
|
| 4
| Биология
| +
| +
| +
| +
|
| 5
| Анатомия человека
| +
| +
| +
| +
|
| 7
| Гистология, цитология, эмбриология
| +
| +
| +
| +
|
| 8
| Нормальная физиология
| +
| +
| +
| +
|
| 9
| Микробиология, вирусология
| +
| +
| +
| +
|
| 11
| Фармакология
| +
| +
| +
| +
|
| 13
| Патофизиология, клиническая патофизиология
| +
| +
| +
| +
|
| 14
| Гигиена
| ++
|
|
|
|
| 15
| Медицинская реабилитация
| +
| +
| +
| +
|
| 16
| Клиническая фармакология
| +
| +
| +
| +
|
| 17
| Дерматовенерология
| +
| +
|
|
|
| 18
| Неврология, медицинская генетика, нейрохирургия
| +
| +
| +
| +
|
| 19
| Офтальмология
| +
| +
| +
|
|
| 20
| Судебная медицина
| +
| +
| +
| +
|
| 21
| Медицина катастроф, безопасность жизнедеятельности
| +
|
|
| +
|
| 22
| Пропедевтика внутренних болезней, лучевая диагностика
| +
|
|
| +
|
| 23
| Факультетская терапия, профессиональные болезни
| +
|
| +
| +
|
| 24
| Инфекционные болезни
| +
|
| +
| +
|
| 25
| Общая хирургия, лучевая диагностика
| +
|
|
| +
|
| 26
| Анестезиология, реанимация, интенсивная терапия
| +
|
|
|
|
| 27
| Стоматология
| +
|
|
|
|
| 28
| Онкология, лучевая терапия
| +
|
| +
| +
|
| 29
| Травматология, ортопедия
| +
|
|
|
|
| 30
| Основы формирования здоровья детей
| +
|
|
| +
|
| 31
| Пропедевтика детских болезней
| +
|
|
| +
|
| 32
| Инфекционные болезни у детей
| +
|
|
| +
|
|
МЕТОДИЧЕСКИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ОРГАНИЗАЦИИ ИЗУЧЕНИЯ УЧЕБНОЙ ДИСЦИПЛИНЫ
Методические рекомендации (материалы) преподавателю (представлены - см. разделы III настоящего УМК) Перечень:
Раздел № 1 учебного плана
|