Применение информационных технологий в биохимии

Скачать 383.36 Kb.

Название	Применение информационных технологий в биохимии
страница	1/9
Дата публикации	25.04.2015
Размер	383.36 Kb.
Тип	Реферат

100-bal.ru > Информатика > Реферат

1 2 3 4 5 6 7 8 9

БЕЛОРУССКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ УНИВЕРСИТЕТ

Выпускная работа по
«Основам информационных технологий»

5БФ123

Магистрантки

биологического факультета

кафедры биохимии

Петровой Светланы Михайловны

Руководитель:

кандидат биологических наук, доцент

Шолух Михаил Васильевич

Старший преподаватель

Шешко Сергей Михайлович

Минск – 2010

Оглавление 3

Список обозначений к выпускной работе 4

Реферат на тему «Применение информационных технологий в биохимии» 5

Введение 5

Глава 1 Обзор литературы 6

1.1 Банки и базы данных первичных аминокислотных последовательностей 6

1.2 Базы данных пространственной структуры макромолекул 7

1.3 Характеристика ресурса PredictProtein 9

Глава 2 Методика исследования 10

2.1 Распознавание вторичной структуры белков 10

2.2 Моделирование белка по гомологии 13

2.3 Распознавание фолда 18

Обсуждение результатов 23

Заключение 25

Список литературы к реферату 26

Предметный указатель к реферату 27

Интернет ресурсы в Предметной области исследования 28

Действующий личный сайт в www 33

Граф научных интересов 34

Тестовые вопросы по основам информационных технологий 36

Презентация магистерской диссертации 38

Список литературы к выпускной работе 39

ПРиложение 40

Список обозначений к выпускной работе

ID PDB	Идентификационный номер в PDB
ID(id)	Идентификационный номер
ID Chai	Идентификационный номер цепи
NMR	Nuclear magnetic resonance
PDB	Protein Data Base (база данных белков)

Реферат на тему «Применение информационных технологий в биохимии»

Введение

Современная молекулярная биология к настоящему времени накопила огромные объемы экспериментальных данных, хранящиеся, в том числе, и в компьютерных базах данных. Осмысливание этих данных принципиально невозможно без привлечения современных информационных технологий и эффективных методов анализа и моделирования биологических систем и процессов. Именно этим и занимается биоинформатика или информационная биология. Эта наука возникла в 1976-1978 годах, но окончательно оформилась в 1980 году со специальным выпуском журнала «Nucleic Acid Research» Объектами исследований биоинформатики являются ДНК, РНК, белки, фундаментальные процессы – репликация, транскрипция, трансляция; генетические, белковые и другие сети [1].

Протеомика – одно из современных молекулярно-биологических направлений, тесно связанных с биоинформатикой, которое стоит в одном ряду с геномикой, транскриптомикой, метаболомикой, цитомикой и пептидомикой. Протеомика объединяет имеющиеся знания о всех существующих белках и протеинах (протеоме) всех организмов [2, 3].

Термин «протеом» был предложен Марком Вилкинсом в 1995 году и используется для описания всей совокупности белков определенного организма или какой-либо системы в данный момент времени «общий протеом организма» и клеточного протеома, включающий все белки определенной клетки на конкретной стадии дифференцировки, развивающейся в определенных условиях.

Можно сказать, что протеом - это белковый эквивалент генома. Однако, кроме знаний о последовательности, структуре белковых молекул для протеома очень важны знания о взаимодействиях различных белков.

Таким образом, протеомика предполагает изучение состава, структуры, функции и взаимодействий белковых молекул отдельной клетки или организма в целом. Выделяют несколько направлений в протеомике, которые ставят перед собой различные цели:

• выделение белков, их разделение и идентификация,

• определение аминокислотной последовательности, вторичной и третичнойструктуры белков (структурная протеомика),

• посттрансляционные модификации белковых молекул,

• белок-белковые взаимодействия,

• клеточная протеомика (изучение внутриклеточной локализации белков, их участия в реализации отдельных стадий клеточного цикла),

• экспериментальная биоинформатика в области протеомики (создание и усовершенствование существующих экспериментальных и биоинформационных методов для выявления новой информации и создания новых баз данных о белках) [2].

Целью данной работы является анализ современных информационных технологий, позволяющих предсказать свойства целевых белков на основе особенностей их строения.

Задачи:

охарактеризовать подходы, используемые на данном этапе для предсказания структуры белков на основе данных об их аминокислотном составе и некоторых других особенностях строения;
рассмотреть программное обеспечение и Internet-серверы, применяемые для моделирования структуры белков и базы данных в которых содержится информация по аминокислотным последовательнастям;
изучить проекты, используемые для сравнения результатов, полученных при применении различного программного обеспечения для предсказания структуры белков;

1 2 3 4 5 6 7 8 9

Добавить документ в свой блог или на сайт

Похожие:

	Применение информационных технологий в физиологии и биохимии растений Характеристика информационных технологий, применяемых в физиологии и биохимии 5		Применение информационных технологий в системе образования Понятие информационных технологий. Роль средств новых информационных технологий в образовании 10
	Применение информационных технологий в исследованиях поэтических... Применение информационных технологий в исследованиях поэтических особенностей стиля Ю. Левитанского 12		Применение информационных технологий в изучении истории древнего... Применение информационных технологий в изучении истории древнего мира в 5-ых классах
	Применение информационных технологий на уроках английского языка... Возможности использования информационно-коммуникативных технологий в обучении английскому языку 17		Программа профессионального модуля пм. 07 «Применение информационных... ПМ. 07 "Применение информационных технологий в профессиональной деятельности" разработана на основе Федерального государственного...
	Выпускная работа по «Основам информационных технологий» Реферат: «Применение информационных технологий в исследовании и описании безэквивалентной лексики» 6		Выпускная работа по «Основам информационных технологий» «Применение информационных технологий в географии на примере оценки недвижимости» 5
	Выпускная работа по «Основам информационных технологий» Реферат по ит в предметной области: «Применение информационных и коммуникационных технологий в обучении иностранному языку» 4		Выпускная работа по «Основам информационных технологий» на тему «Применение... Реферат «Применение информационных технологий в решении нелинейных уравнений методом последовательных приближений.» 3
	Применение информационных технологий на уроках истории и обществоведения... Возможности использования информационно-коммуникативных технологий в обучении истории 17		Курсовая работа на тему: Применение информационных технологий на рабочем месте пользователя Тема курсовой работы: «Применение информационных технологий на рабочем месте пользователя»
	Применение информационных технологий для эконометрического анализа... Гоу впо «башкирская академия государственной службы и управления при президенте республики башкортостан»		Применение информационных технологий в производственной деятельности Реферат на тему «применение информационных технологий в производственной деятельности» Введение 4
	Применение информационных технологий в банковской сфере Банки стараются извлекать информацию о своих клиентах, предоставлять им банковские услуги наиболее приемлемым способом, в связи с...		Применение информационных технологий в педагогической деятельности Для подготовки к урокам и классным часам с использованием информационных технологий приходилось затрачивать много времени и, одновременно...

Школьные материалы